Flavivirus patogeni per l'uomo

I Flavivirus patogeni per l'uomo sono 32 specie, secondo E.A. Gould e T. Solomon Dipartimento di Scienze Neurologiche dell'Università di Liverpool (Lancet 2008).[1]

Virologia

I flavivirus utilizzano diverse strategie genomiche di replicazione all'interno dell'ospite, anche perché utilizzano diversi insetti vettori e diversi ospiti mammiferi.

Oltre alla codifica delle proteine virali, il genoma virale contiene segnali speciali in strutture del proprio RNA che regolano l'amplificazione delle componenti virali e partecipano all'attivazione o all'elusione delle risposte antivirali. In questa ottica assumono un ruolo prevalente, per le funzioni specifiche per l'adattamento all'ospite, le strutture dell'RNA presenti nella regione non tradotta (3 UTR) del genoma dei flavivirus.[2]

In particolare il virus Dengue si adatta alle zanzare o alle cellule umane selezionando diverse varianti virali. La specializzazione all'ospite (host) delle strutture di RNA presenti nella regione 3'UTR è associata a guadagni della "salute virale". Infatti, la replicazione degli elementi del RNA virale comporta esigenze contrastanti nei diversi tipi cellulari in cui si esplica.[2]

I flavivirus appartengono a 4 gruppi con specifiche strategie genomiche. Essi sono:[2]

1. Flavivirus trasmessi dalle zanzare (Mosquito-borne flaviviruses)
2. Flavivirus insetto specifico (Insect-specific flaviviruses)
3. Flavivirus trasmessi dalle zecche (Tick borne flaviviruses)
4. Flavivirus con vettore sconosciuto (No-known-vector flaviviruses)

Ognuno di questi gruppi possiede una regione genomica del tipo SLA (stem-loop A) in cui differisce la sequenza di basi nucleotidiche e la struttura tridimenzionale.

Vettori

I vettori tradizionali sono:[3]

• zanzare
• zecche (nei climi più freddi)

I virus trasmessi dalle zanzare hanno tassi di evoluzione più elevati.

Ospiti

I flavivirus di solito hanno ospiti animali ad alto tasso riproduttivo, ciò perché così trovano sempre ospiti immunologicamente naive. Gli ospiti naturali dei flavivirus difficilmente subiscono infezioni rapidamente mortali perché così altrimenti si avrebbe una rapida estinzione della diffusione del virus. L'uomo non subendo generalmente grandi viremie nel proprio organismo (sangue) diventa per il virus un ospite terminale o "vicolo cieco"; fanno eccezione la Dengue e la febbre gialla dove l'uomo e i primati sono ospiti naturali della malattia.[3]

Clinica

Tradizionalmente, i flavivirus determinano tre le sindromi cliniche note:[3]

• febbre-artralgia-rash,
• febbre emorragica virale,
• malattie neurologiche,

anche se per alcuni flavivirus questo il modello di malattia si sta modificando. L'animale ospite sviluppa dopo l'infezione un'immunità permanente. La malattia da flavivirus è generalmente lieve, di solito sono sindromi febbrili ciò perché è conveniente per il virus non portare a morte l'ospite infetto in modo da avere un'alta percentuale di serbatoi virali per il mantenimento della nicchia ecologica occupata.

Sinossi

Flavivirus patogeni

Specie	Anno primo isolamento	Località primo isolamento	Fonte isolamento	Distribuzione geografica	Specie vettore	Specie ospite	Manifestazione clinica nell'uomo	Note
Alkhurma virus	1995	Arabia del Sud	Uomo	Penisola Arabica	Ornithodorus savignyi?	Uomo, Pecora, Cammello	Febbre emorragica
Apoi virus	1954	Giappone	Roditori	Giappone	Sconosciuto	Roditori?	Encefaliti
Bagaza virus	1966	Repubblica Centro africana	Culex spp	Africa	Culex spp	Sconosciuto	Febbre
Banzi virus	1956	SudAfrica	Uomo	Africa	Culex spp	Sconosciuto	Febbre
Bussuquara virus	1956	Brasile	Alouatta belzebul	Brasile	Culex spp	Sconosciuto	Febbre
Dakar bat virus	1962	Senegal	Pipistrello	Africa	Sconosciuto	Pipistrelli?	Febbre
Dengue 1 virus	1944	Hawai	Uomo	Tropici, subtropici	Aedes aegypti	Uomo	Febbre, rash, vasculopatie	390 milioni di casi/anno nel mondo, disponibili due vaccini[4][2]
Dengue 2 virus	1944	Nuova Guinea	Uomo	Tropici, subtropici	Aedes aegypti	Uomo	Febbre, rash, vasculopatie
Dengue 3 virus	1957	Filippine	Uomo	Tropici, subtropici	Aedes aegypti	Uomo	Febbre, rash, vasculopatie
Dengue 4 virus	1956	Filippine	Uomo	Tropici, subtropici	Aedes aegypti	Uomo	Febbre, rash, vasculopatie
Ilheus virus	1957	Brasile	Aedes e Psorophora	America Sud e Centrale America	Culex spp?	Uccelli	Febbre
Japanese encephalitis virus	1935	Giappone	Uomo	Asia	Culex trita-eniorhynchus	Uccelli	Encefaliti	In espansione, epidemiologicamente la più importante malgrado i vaccini[3]
Koutango virus	1969	Senegal	Tatera kempi	Senegal	Sconosciuto	Roditori?	Febbre, rash
Kyasanur Forest disease	1957	India	Presbytis entellus	India	Haemaphysalis spinigera	Scimmie	Febbre emorragica	Epidemie circoscritte, vettore zecca[3]
Langat virus	1956	Malesia	Ixodes Granulatus	Malesia, Thailandia, Siberia	Ixodes granulatus	Sconosciuto	Encefaliti
Louping ill virus	1929	Scozia	Ovini	UK, Irlanda	Ixodes spp	Pecore, pernici, lepri	Encefaliti
Modoc virus	1958	USA	Peromyscus	USA	Sconosciuto	Peromyscus maniculatus	Encefaliti
Murray Valley encephalitis	1951	Australia	Uomo	Australia, Nuova Guinea	Culex annulirostris	Uccelli	Encefaliti
Ntaya virus	1943	Uganda	Zanzare	Africa	Zanzare	Sconosciuto	Febbre
Omsk haemorrhagic fever virus	1947	Russia	Uomo	Ovest Siberia	Dermacentor pictus	Topi muschiati, roditori?	Febbre emorragica	Epidemie circoscritte, vettore zecca; trasmessa anche con carcasse infette[3]
Powassan virus	1948	Russia, USA, Canada	Ixodes spp, Dermacentor spp, Haemaphysalis spp	Russia, USA, Canada	Ixodes spp	Piccoli mammiferi	Encefaliti
Rio Bravo virus	1954	USA	Tadarida brasiliensis mexicana	USA, Mexico	Sconosciuto	Tadarida brasiliensis mexicana	Febbre
Rocio virus	1975	Brasile	Uomo	Brasile	Culex spp?	Uccelli	Encefaliti
St Louis encephalitis virus	1933	USA	Uomo	Sud e America Centrale	Culex spp	Uccelli	Encefaliti
Sepik virus	1966	Nuova Guinea	Mansonia septempunctata	Nuova Guinea	Zanzare	Sconosciuto	Febbre
Spondweni virus	1955	Sud Africa	Mansonia uniformis	Africa	Aedes circumluteolus	Sconosciuto	Febbre
Tick-borne encephalitis virus	1937	Russia	Uomo	Europa, Asia	Ixodes spp	Roditori?	Encefaliti	Epidemie circoscritte, vettore zecca; trasmessa anche con il latte.[3] Prima: Russian spring–summer encephalitis
Usutu virus	1956	Sud Africa	Culex spp	Africa	Zanzare	Uccelli	Febbre, rash
Wesselsbron virus	1955	Sud Africa, Madagascar e Thailand	Ovini	Africa, Asia	Aedes spp	Sconosciuto	Sconosciuto
West Nile virus	1937	Uganda	Uomo	Worldwide	Zanzare, zecche	Uccelli	Encefaliti	In espansione[3]
Yellow fever	1927	Ghana	Uomo	Sub-Sahara Africa, Sud America	Aedes spp/ Haemagogus spp	Scimmie	Pantropica	200.000 casi/anno con 30.000 morti nel mondo.[2]
Zika virus	1947	Uganda	Macaca mulatta	Africa, Asia	Aedes spp	Scimmie?	Febbre, rash	dal 2007 Micronesia, dal 2015 Sud-America[5]

Note

1. Gould EA, Solomon T, Pathogenic flaviviruses, in Lancet, vol. 371, n. 9611, 2008, pp. 500-9, DOI:10.1016/S0140-6736(08)60238-X, PMID 18262042.
2. Villordo SM, Carballeda JM, Filomatori CV, Gamarnik AV, RNA Structure Duplications and Flavivirus Host Adaptation, in Trends Microbiol., 2016, DOI:10.1016/j.tim.2016.01.002, PMID 26850219.
3. Solomon T, Mallewa M, Dengue and other emerging flaviviruses, in J. Infect., vol. 42, n. 2, 2001, pp. 104-15, DOI:10.1053/jinf.2001.0802, PMID 11531316.
4. Istituto Superiore di Sanità, ISS - Febbre dengue, su epicentro.iss.it.
5. Gatherer D, Kohl A, Zika virus: a previously slow pandemic spreads rapidly through the Americas, in J. Gen. Virol., 2015, DOI:10.1099/jgv.0.000381, PMID 26684466.

Bibliografia

Testi

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• The Flaviviruses: Structure, Replication and Evolution, Academic Press, 18 dicembre 2003, ISBN 978-0-08-049381-7.
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Voci correlate

• Classificazione di Baltimore
• Virus a DNA
• Virus a RNA

Collegamenti esterni

• (EN) MicrobiologyBytes: Flavivirus, su microbiologybytes.com. URL consultato il 17 gennaio 2016 (archiviato dall'url originale il 23 aprile 2015).
• (EN) Viralzone: Flavivirus, su expasy.org. URL consultato il 16 gennaio 2016 (archiviato dall'url originale il 13 giugno 2010).
• (EN) Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR) - Flaviviridae - Genome database with visualization and analysis tools, su viprbrc.org. URL consultato il 9 febbraio 2016.