SLAMF1

SLAMF1
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 1M27, 1KA7, 1I3Z, 1D4T, 1D4W, 1KA6
Identifiants
Aliases	SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule family 1, CD150
IDs externes	OMIM: 603492 MGI: 1351314 HomoloGene: 48162 GeneCards: SLAMF1
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 1 humain[1] Locus 1q23.3 Début 160,608,106 bp[1] Fin 160,647,044 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 1 (souris)[2] Locus 1 H3|1 79.54 cM Début 171,594,695 bp[2] Fin 171,628,752 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans thymus ganglion lymphatique granulocyte appendice iléo-cæcal sang tonsille cellule de la moelle osseuse rate rectum pancreatic ductal cell Fortement exprimé dans sang thymus zygote secondary oocyte primary oocyte tibiofemoral joint rate ganglion mésentérique embryon embryon Plus de données d'expression de référence BioGPS Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison d'antigène virus receptor activity liaison protéique transmembrane signaling receptor activity identical protein binding signaling receptor activity Composant cellulaire integral component of membrane membrane membrane plasmique région extracellulaire surface cellulaire phagocytic vesicle exosome external side of plasma membrane Processus biologique adaptive immune response processus du système immunitaire natural killer cell proliferation T-helper 1 cell cytokine production negative regulation of interleukin-6 production positive regulation of JNK cascade adhésion cellulaire negative regulation of CD40 signaling pathway negative regulation of T cell cytokine production myeloid dendritic cell activation involved in immune response regulation of vesicle fusion positive regulation of cell population proliferation positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade phagocytose activation des lymphocytes pénétration virale negative regulation of tumor necrosis factor production système immunitaire inné regulation of catalytic activity viral process positive regulation of activated T cell proliferation negative regulation of interleukin-12 production natural killer cell differentiation transduction de signal leukocyte chemotaxis involved in inflammatory response positive regulation of macrophage chemotaxis positive regulation of dendritic cell chemotaxis Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 6504 27218 Ensembl ENSG00000117090 ENSMUSG00000015316 UniProt Q13291 Q9QUM4 RefSeq (mRNA) NM_003037 NM_001330754 NM_013730 NM_001360898 RefSeq (protéine) NP_001317683 NP_003028 NP_038758 NP_001347827 Localisation (UCSC) Chr 1: 160.61 – 160.65 Mb Chr 1: 171.59 – 171.63 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
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Le SLAMF1 (pour « Signaling lymphocytic activation molecule family 1 ») ou CD150 est une protéine appartenant à la famille des SLAMs. Son gène est SLAMF1 situé sur le chromosome 1 humain.

Rôles

Comme les autres protéines SLAM, il joue un rôle de transduction de signal dans l'immunité.

En médecine

Sa présence est un facteur de bon pronostic en cas de leucémie lymphoïde chronique[5], son absence favorisant l'autophagie[6].

Notes et références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000117090 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015316 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. Schweighofer CD, Coombes KR, Barron LL et al. A two-gene signature, SKI and SLAMF1, predicts time-to-treatment in previously untreated patients with chronic lymphocytic leukemia, PLoS One, 2011;6:e28277
6. Bologna C, Buonincontri R, Serra S et al. SLAMF1 regulation of chemotaxis and autophagy determines CLL patient response, J Clin Invest, 2016;126:181-194