Die Virgaviridae sind eine Familie von einzelsträngigen RNA-Viren mit positiver Polarität. Ihre natürlichen Wirte sind Pflanzen.[3][4][5][6]
Derzeit (Stand Mai 2024) gibt es mindestens 59 Arten in dieser Familie, aufgeteilt in 7 Gattungen.[4][5][7]
Der Name der Familie leitet sich von lateinischvirga‚Stock, Stab‘,[8] auch ‚Stange‘, ab (da alle Viren in dieser Familie stab- oder stangenförmig sind).
Schemazeichnung eines Virusteilchens aus der Familie Virgaviridae (exemplarisch Gattung Tobamovirus), aufgeschnitten
Die Virusteilchen (Virionen) der Virgaviridae sind nicht umhüllt, ihre Geometrie ist starr stabförmig und sie haben eine mit helikale Symmetrie. Der Durchmesser liegt bei 20–25 nm,[4][5]
Die Virionen haben einen zentralen „Kanal“.
RNARNARNA
Das Genom besteht aus einer linearen, einzelsträngigen Positiv-Sense-RNA[4][5]
mit einer 3'-tRNA-ähnlichen Struktur und keinem Poly-A-Schwanz.
Das Genom kann je nach Gattung in einem, zwei oder drei Segmenten vorliegen (mono-, bi- oder tripartit).
Die Hüllproteine haben eine Größe von 19 bis 24 Kilodalton.[4][5]
Vermehrungszyklus
Die Replikation der Virusteilchen erfolgt cytoplasmatisch (d. h. sie findet im Zytoplasma statt) und folgt dem Replikationsmodell von Positivstrang-RNA-Viren. Ebenso ist die
Transkriptionsmethode die übliche für Positivstrang-RNA-Viren.
Die Übersetzung benutzt durch Leaky-Scanning und Unterdrückung der Terminierung.
[4][5]
Kooninet al haben 2015 die Virgaviridaetaxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[14] Schwestergruppe ist danach die Familie Closteroviridae. Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[15]
Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.
Obwohl ihre Mitglieder stäbchenförmig sind und Pflanzen infizieren gehört die Gattung Benyvirus nicht zu dieser Familie, sondern zu den Benyviridae; die Proteine der beiden Gruppen sind offenbar nur weitläufig verwandt.[21]
Eine weitere verwandte Gattung ist vorschlagsgemäß Charavirus mit den Spezies Charavirus canadensis (CV-Can) und Charavirus australis (CV-Aus), diese Viren befallen Charophyten.[22]
↑Michael J. Adams, Scott Adkins, Claude Bragard, David Gilmer, Dawei Li, Stuart A. MacFarlane, Sek-Man Wong, Ulrich Melcher, Claudio Ratti, Ki Hyun Ryu: ICTV Virus Taxonomy Profile: Virgaviridae. In: Journal of General Virology. 98. Jahrgang, Nr.8, 1. August 2017, S.1999–2000, doi:10.1099/jgv.0.000884, PMID 28786782, PMC 5656781 (freier Volltext) – (englisch).
↑M. J. Adams, J. F. Antoniw, J. Kreuze: Virgaviridae: a new family of rod-shaped plant viruses. In: Arch Virol, Band 154, Nr. 12, 2009, S. 1967–1972; doi:10.1007/s00705-009-0506-6 (englisch).
↑M. J. Adams, P. Jones, A. G. Swaby: Purification and some properties of oat golden stripe virus. In: Annals of Applied Biology, April 1988; doi:10.1111/j.1744-7348.1988.tb02064.x (englisch).
↑BE Min, BN Chung, MJ Kim, JH Ha, BY Lee, KH Ryu: Cactus mild mottle virus is a new cactus-infecting tobamovirus. In: Archives of Virology. 151. Jahrgang, Nr.1, Januar 2006, S.13–21, doi:10.1007/s00705-005-0617-7, PMID 16132178 (englisch).
↑Da diese Gruppe (von den Autoren als englischsuperfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
↑Marli Vlok, Adrian J. Gibbs. Curtis A. Suttle: Metagenomes of a Freshwater Charavirus from British Columbia Provide a Window into Ancient Lineages of Viruses. In: Viruses, Band 11, Nr. 3, S. 299, 25. März 2019; doi:10.3390/v11030299, PMC 6466400 (freier Volltext), PMID 30934644 (englisch).
