* Penampilan dan gol di klub senior hanya dihitung dari liga domestik dan akurat per 2 September 2023 ‡ Penampilan dan gol di tim nasional akurat per 10 September 2023
Dia bermain sebagai pemain remaja untuk BK Skjold, F.C. Copenhagen dan Brøndby IF sebelum bergabung dengan klub Jerman Bayern München pada tahun 2012. Dia melakukan debut seniornya di tim cadangan tahun itu dan debut profesionalnya untuk tim utama pada April 2013; pada usia 17 dia adalah pemain termuda klub di Bundesliga. Dia membuat total 25 penampilan untuk Bayern dan memenangkan berbagai turnamen domestik dan internasional, juga dipinjamkan ke sesama tim Bundesliga, FC Augsburg dan Schalke 04. Pada tahun 2016, dia menandatangani kontrak lima tahun untuk Southampton dengan biaya sekitar £ 12,8 juta. Setelah tampil lebih dari 130 kali untuk The Saints, ia kemudian bergabung dengan Tottenham Hotspur pada tahun 2020 dengan bayaran awal yang dilaporkan sebesar £ 15 juta.
Pierre Højbjerg adalah produk dari akademi remaja BK Skjold, ia pindah ke FC Copenhagen pada 2007, tetapi dua tahun setelah itu ia memutuskan pindah ke tim rival, Brøndby IF[3] pada tahun 2009 dan pindah lagi ke Bayern Munich tiga tahun setelahnya.[4]
Pada Maret 2013, ia berada di bangku cadangan Bayern Munich untuk pertama kalinya ketika Bayern Munich bertemu Bayer Leverkusen, tapi ia tidak dipakai sebagai pemain pengganti.[5] Saat berusia 17 tahun, 251 hari, ia membuat debut profesionalnya pada laga Bundesliga tanggal 13 April 2013 melawan 1. FC Nürnberg, ia bertindak sebagai pemain pengganti yang menggantikan Xherdan Shaqiri[6][7] dan dengan demikian ia menjadi pemain termuda yang pernah bermain dengan tim utama Bayern Munich di Bundesliga.[8]
^"DBU's Talentpris" (dalam bahasa Denmark). DBU. Diarsipkan dari versi asli tanggal 2013-05-22. Diakses tanggal 13 April 2013.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
^"Pierre-Emile Højbjerg vinder prisen som Årets Talent" (dalam bahasa Danish). Spillerforeningen. 1 December 2013. Diarsipkan dari versi asli tanggal 3 December 2013. Diakses tanggal 2 December 2013.Parameter |url-status= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
