Pemerintahan memiliki tiga cabang interdependen: legislatif, eksekutif, dan yudisial. Kekuasaan tiap cabang dijamin oleh Konstitusi Filipina sebagai berikut: kekuasaan legislatif berada pada dua kamar (bikameral) Kongres Filipina—Senat adalah majelis tinggi dan Dewan Perwakilan Rakyat adalah majelis rendah.[1]
Kekuasaan legislatif dipegang oleh Kongres Filipina yang terdiri dari Senat dan DPR. Majelis tinggi berlokasi di Kota Pasay, sementara majelis rendah berlokasi di hotel yang terletak strategis di Kota Quezon. Keduanya berada di Metro Manila. Perwakilan distrik dan sektoral dipilih untuk jangka waktu tiga tahun. Mereka dapat dipilih kembali tetapi mereka tidak dapat mencalonkan diri empat kali berturut-turut.
Senator dipilih untuk masa jabatan enam tahun. Mereka dapat dipilih kembali tetapi tidak dapat mencalonkan diri tiga kali berturut-turut. DPR dapat memilih untuk berlalu dalam kekosongan kursi legislatif, yang mengarah ke pemilihan khusus. Pemenang pemilihan khusus akan menempati jabatan perwakilan distrik yang belum selesai masanya dan akan dianggap sebagai satu jangka waktu pemilihan. Aturan yang sama juga berlaku di Senat, namun itu hanya berlaku jika kursi dikosongkan sebelum reguler pemilu legislatif.
Kekuasaan eksekutif dipegang oleh Presiden Filipina. Presiden dipilih oleh rakyat. Kantor utama Presiden berada di Istana Malacanang di San Miguel, Manila. Cabang eksekutif saat ini dipimpin oleh Presiden Rodrigo Duterte. Presiden juga adalah Panglima Tertinggi of the Angkatan Bersenjata Filipina,
Pejabat tertinggi kedua terpilih secara terpisah dari Presiden berdasarkan suara terbanyak. Saat ini Wakil Presiden adalah Leni Robredo. Wakil Presiden adalah yang pertama dalam antrean untuk suksesi jika Presiden mengundurkan diri, diberhentikan, atau meninggal. Wakil Presiden biasanya—meskipun tidak selalu—seorang anggota dari Kabinet Presiden. Jika ada kekosongan di posisi wakil presiden, Presiden akan menunjuk anggota Kongres—biasanya anggota partai—sebagai Wakil Presiden baru. Penunjukan harus disetujui oleh tiga perempat suara Kongres.[2]
Jenis pengadilan lainnya, dari berbagai yurisdiksi di seluruh nusantara, adalah:
Pengadilan Tinggi Rendah:
Pengadilan Banding
Pengadilan Banding Perpajakan
Sandiganbayan
Pengadilan Regular:
Pengadilan Banding
Daerah
Pengadilan Lingkup Kotapraja
Pengadilan Muslim
Pengadilan Distrik Syariah
Pengadilan Lingkup Syariah
Komisi Konstitusi
Pasal 9 Konstitusi Filipina menetapkan tiga komisi konstitusional: Komisi Pelayanan Sipil, Komisi Pemilihan Umum, dan Komisi Audit.
Kantor Ombudsman
Pemerintah dan semua tiga dari cabang-cabangnya secara mandiri diawasi oleh Ombudsman (Filipino: Tanodbayan). Ombudsman diberi mandat untuk menyelidiki dan menuntut setiap pejabat pemerintah yang diduga bersalah atas kejahatan, terutama Gratifikasi dan Korupsi. Ombudsman dibantu oleh enam deputi: Keseluruhan Deputi, Deputi Luzon, Deputi Visayas, Deputi Mindanao, Deputi Angkatan Bersenjata, dan Jaksa Khusus.
Filipina memiliki empat klasifikasi utama pembagian administratif pemilihan, sering disatukan sebagai unit pemerintah daerah (LGUs). Divisi dari yang tertinggi sampai yang terendah ialah sebagai berikut:
Otonomi daerah
Provinsi (lalawigan, probinsiya, kapuoran) dan kota independen (lungsod, siyudad/ciudad, dakbayan, dakbanwa, lakanbalen)
Pemerintah kota (bayan, balen, bungto, banwa) dan kota bagian (lungsod, siyudad/ciudad, dakbayan, dakbanwa, lakanbalen)
Di luar dari daftar tersebut, pemerintah nasional mengelompokan provinsi dan kota-kota independen ke wilayah pemilihan, misalnya Metro Manila atau Wilayah VI. Presiden memiliki hak prerogatif untuk membuat, menghapus, dan menentukan komposisi dari daerah, yang dikerjakan sehingga konsultasi dengan satuan kerja pemerintah daerah sering kali terkena dampak; terkecuali daerah otonom, di mana unit pemerintah penduduk lokal harus meratifikasi di dalam plebisit masuknya mereka dalam pengaturan tersebut.