Martin Chalfie mendapat hadiah Nobel untuk bidang kimia tahun 2008 bersama-sama dengan Osamu Shimomura dan Roger Y. Tsien untuk penemuan mereka dalam pengembangan protein hijau berpendar, GFP (green fluorescent protein). Chalfie adalah orang yang pertama kali menunjukkan bagaiman memanfaatkan gen penghasil GFP sebagai penanda untuk menunjukkan ekspresi gen. Salah satu penelitian pertamanya adalah dengan mewarnai enam sel nematoda tembus pandang Caenorhabditis elegans.[2]