Pada 1796, jenderal muda Napoleon dikirim oleh Republik Prancis untuk menghadapi Austria, sebagai bagian dari front Italia dalam Perang Revolusi Prancis. Dia memilih melewati Venesia, negara yang bersikap netral. Meski terpaksa, Venesia mengizinkan tentara Prancis yang tangguh untuk memasuki negara mereka sehingga Prancis dapat berhadapan dengan Austria. Namun, Prancis secara sembunyi-sembunyi mulai mendukung revolusioner Jacobin yang ada di Venesia, dan senat Venesia mulai diam-diam bersiap untuk perang. Pasukan bersenjata Venesia sudah sedikit jumlahnya dan hampir tidak sebanding dengan Prancis teruji dalam pertempuran atau bahkan dengan pemberontakan lokal. Setelah direbutnya Mantua pada 2 Februari 1797, Prancis membuang semua dalih dan secara terbuka menyerukan revolusi di wilayah Venesia. Per 13 Maret, ada pemberontakan terbuka, dengan Brescia dan Bergamo melepaskan diri. Namun, sentimen pro-Venesia masih tinggi, dan Prancis dipaksa mengungkapkan tujuan sebenarnya setelah mereka menyediakan bantuan militer kepada kaum revolusioner yang berkinerja buruk.
Pada 25 April, Napoleon secara terbuka mengancam akan menyatakan perang terhadap Venesia kecuali negara tersebut didemokratisasi. Senat Venesia menyetujui berbagai tuntutan, tetapi menghadapi pemberontakan yang meningkat dan ancaman invasi asing, Senat turun takhta dan mendukung pemerintahan transisi Jacobin (demikian pula Prancis). Pada 12 Mei, Ludovico Manin, doge Venesia terakhir, secara resmi membubarkan Republik Paling Damai Venesia setelah 1.100 tahun eksistensinya.
Prancis dan Austria secara rahasia sepakat pada 17 April dalam Perjanjian Leoben bahwa sebagai imbalan menyerahkan Venesia kepada Austria, Prancis akan mendapatkan wilayah Austria yang ada di Belanda. Prancis memberikan kesempatan kepada penduduk untuk memberikan suara dalam menerima persyaratan perjanjian yang sekarang menjadi publik di mana mereka diserahkan kepada Austria. Pada 28 Oktober, Venesia memilih untuk menerima persyaratan tersebut. Lebih memilih Austria daripada Prancis memiliki dasar yang kuat: Prancis pun mulai menjarah seluruh Venesia. Mereka kemudian mencuri atau menenggelamkan seluruh Angkatan Laut Venesia dan menghancurkan sebagian besar Gudang Senjata Venesia, akhir yang memalukan bagi salah satu angkatan laut terkuat di Eropa tersebut.
Pada 18 Januari 1798, Austria mengambil alih Venesia dan mengakhiri penjarahan. Namun, Austria mengendalikan dalam waktu singkat, karena Venesia kembali di bawah kendali Prancis pada 1805. Venesia kemudian dikembalikan kepada Austria pada 1815 sebagai Kerajaan Lombardia–Venesia hingga penyatuannya ke dalam Kerajaan Italia pada 1866.
Pengeklaim takhta Prancis, Louis Stanislas Xavier (di masa depan Louis XVIII), pernah menghabiskan waktu pada 1794 di Verona, sebagai tamu di Republik Venesia. Hal ini menyebabkan protes keras dari para perwakilan Prancis, sehingga hak suaka Louis dicabut, dan dia dipaksa pergi dari Verona pada 21 April. Sebagai bentuk protes, pangeran Prancis menuntut agar namanya dihapus dari libro d'orokebangsawanan Venesia, dan agar baju besi Henri IV dari Prancis yang disimpan di Venesia dikembalikan kepadanya. Perlakuan oleh pemerintah Venesia juga menimbulkan ketidaksenangan dan kecaman dari istana Eropa lainnya.
Pada 1795, dengan Konstitusi Tahun III, Prancis mengakhiri kekacauan Rezim Teror, dan memasang rezim Direktori yang lebih konservatif. Pada 1796, Direktori memerintahkan dilancarkannya serangan bercabang dua berskala besar terhadap Koalisi Pertama: serangan utama ke arah timur melewati sungai Rhine (di bawah Jean-Baptiste Jourdan dan Jean Victor Marie Moreau) ke negara-negara bagian Jerman di Kekaisaran Romawi Suci, dan serangan pengalih perhatian terhadap Austria dan sekutunya di selatan, yang ada di Italia utara. Kepemimpinan kampanye Italia diserahkan kepada jenderal muda (saat itu berumur 27 tahun) Napoleon Bonaparte, yang pada April 1796 menyeberangi pegunungan Alpen bersama 45.000 pasukan untuk menghadapi Austria dan Piemont.
Dalam kampanye kilat, Napoleon berhasil membuat Sardinia keluar dari perang, dan kemudian beralih ke Kadipaten Milan, yang dikuasai oleh pasukan Habsburg. Pada 9 Mei Adipati Agung Ferdinand, gubernur Milan asal Austria, pensiun bersama keluarganya di Bergamo, di wilayah Venesia. Enam hari kemudian, setelah memenangkan Pertempuran Lodi, Napoleon memasuki Milan, dan memaksa Raja Victor Amadeus III dari Sardinia untuk menandatangani Perjanjian Paris yang menghinakan, sementara pasukan Habsburg ditarik mundur untuk mempertahankan Keuskupan Trento. Pada 17 Mei Kadipaten Modena juga mengupayakan gencatan senjata dengan Prancis.
Selama konflik ini berlangsung, Republik Venesia menerapkan kebijakan netralitas seperti biasanya, tetapi wilayahnya yang ada di Italia utara (Domini di Terraferma) sekarang berada di depan jalur pergerakan tentara Prancis menuju Wina. Akibatnya, pada 20 Mei Prancis mengkhianati perjanjian gencatan senjata, dan memulai kembali permusuhan.
Dandolo, Girolamo: La caduta della Repubblica di Venezia ed i suoi ultimi cinquant'anni, Pietro Naratovich, Venice, 1855.
Frasca, Francesco: Bonaparte dopo Capoformio. Lo smembramento della Repubblica di Venezia e i progetti francesi d'espansione nel Mediterraneo, in "Rivista Marittima", Italian Ministry of Defence, Rome, March 2007, pp. 97–103.
Romanin, Samuele: Storia documentata di Venezia, Pietro Naratovich, Venice, 1853.
Del Negro, Piero (1998). "Introduzione". Storia di Venezia dalle origini alla caduta della Serenissima. Vol. VIII, L'ultima fase della Serenissima (dalam bahasa Italian). Rome: Istituto della Enciclopedia Italiana. hlm. 1–80.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
Del Negro, Piero (1998). "La fine della Repubblica aristocratica". Storia di Venezia dalle origini alla caduta della Serenissima. Vol. VIII, L'ultima fase della Serenissima (dalam bahasa Italian). Rome: Istituto della Enciclopedia Italiana. hlm. 191–262.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
Preto, Paolo (1998). "Le riforme". Storia di Venezia dalle origini alla caduta della Serenissima. Vol. VIII, L'ultima fase della Serenissima (dalam bahasa Italian). Rome: Istituto della Enciclopedia Italiana. hlm. 83–142.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
Scarabello, Giovanni (1998). "La municipalità democratica". Storia di Venezia dalle origini alla caduta della Serenissima. Vol. VIII, L'ultima fase della Serenissima (dalam bahasa Italian). Rome: Istituto della Enciclopedia Italiana. hlm. 263–355.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
Tabet, Xavier (1998). "Bonaparte, Venise et les îles ioniennes: de la politique territoriale à la géopolitique". Cahiers de la Méditerranée (dalam bahasa French). 57 (1): 131–141. doi:10.3406/camed.1998.1230.Pemeliharaan CS1: Bahasa yang tidak diketahui (link)
