Guterres adalah anggota Komite Sentral FRETILIN (CCF), partai terbesar di Timor Leste yang mengorganisir sebagian besar perlawanan terhadap pendudukan Indonesia. Selama pendudukan, Guterres tinggal di Portugal, di mana dia dan yang lainnya mendirikan Comité de Acção da FRETILIN (CAF).[4] Belakangan, melalui FRETILIN, ia juga menjadi anggota Conselho Nacional de Resistência Timorense (CNRT), organisasi payung partai-partai dan kelompok-kelompok gerakan kemerdekaan Timor Timur. Sebagai duta besar untuk pemerintah negara pendudukan yang tidak diakui, Guterres bertugas di Angola, Mozambik, dan di Perserikatan Bangsa-Bangsa.
Setelah kemerdekaan Timor Leste dipulihkan pada tahun 2002, Guterres menjabat sebagai wakil menteri luar negeri pemerintah hingga tahun 2003. Ia juga menjadi wakil Timor Leste pada KTT Pembangunan Berkelanjutan di Afrika Selatan pada bulan Agustus 2002 dan ketua delegasi Timor Lorosa'e untuk Dewan Menteri pada pertemuan CPLP di Brazil dan pada konferensi ACP / EU di Republik Dominika. pada Juli 2002. Pada 8 Mei 2003 ia menjadi duta besar resmi pertama Timor Leste untuk Perserikatan Bangsa-Bangsa dan Amerika Serikat.
Pada tahun 2006, kerusuhan pecah di Timor Leste setelah pemberontakan hampir setengah dari tentara negara itu. Pemerintahan FRETILIN di bawah Marí Alkatiri akhirnya dipaksa mundur. José Ramos-Horta yang bukan partai mengambil alih jabatan Perdana Menteri Alkatiri. Guterres sebelumnya menolak menjadi perdana menteri dan menjadi menteri luar negeri Timor Leste, bukan Ramos-Horta.[5] Sebagai pemimpin dari kelompok FRETILIN Mudança (FRETILIN-Reformasi) juga untuk menggulingkan Guterres yang gagal pada kongres partai tahun 2006 ketika mencoba untuk Alkatiri sebagai Sekretaris Jenderal FRETILIN.[6]
Guterres tetap menjadi menteri luar negeri hingga 19 Mei 2007. Ramos-Horta memenangkan pemilihan presiden pada 9 Mei 2007 dan karena itu mengundurkan diri sebagai perdana menteri sehari sebelum dia dilantik sebagai Presiden Timor Leste baru. Penggantinya, pria FRETILIN Estanislau da Silva, sekutu Alkatiris, tidak membawa Guterres ke dalam pemerintahan baru. Konfrontasi FRETILIN Mudança dengan partainya sendiri meningkat setelah pemilihan parlemen pada tanggal 30 Juni 2007, yang berakhir untuk FRETILIN dengan hilangnya mayoritas absolut di Parlamento Nacional, meskipun ia tetap menjadi partai terkuat. Alkatiri memperoleh Mudança melawan anggota FRETILIN proses eliminasi partai karena mereka meminta pemilih untuk memilih pesaing utama Xanana Gusmão dari Congresso Nacional da Reconstrução Timorense (CNRT). Para reformis tidak memenuhi permintaan untuk meninggalkan FRETILIN secara sukarela.[6] Guterres dan yang lainnya dikeluarkan dari FRETILIN.[7]
Usai pemilu, Gusmão ditugaskan membentuk pemerintahan sebagai pemimpin koalisi "Aliança da Maioria Parlamentar (AMP)". Anehnya, ia menunjuk José Luis Guterres Wakil Perdana Menteri, yang dianggap sebagai tanda bahwa para reformis di FRETILIN harus diberi kesempatan untuk berpartisipasi dalam pemerintahan.[6] FRETILIN sendiri menolak tawaran berikutnya untuk berpartisipasi dalam pemerintahan.[7]
Pada akhir September 2009, Guterres dituduh melakukan korupsi oleh Sebastião Ximenes, ombudsman Timor Leste. Ximenes diserahkan ke Jaksa Agung menyerahkan laporan untuk investigasi. Sebelum kembali dari jabatannya sebagai duta besar PBB untuk Timor Leste pada tahun 2006, Guterres dikatakan telah menunjuk istrinya Ana Maria Valerio sebagai penasehat duta besar PBB dan menaikkan gajinya dari seorang pegawai biasa menjadi seorang diplomat. Guterres takut bahwa dengan gaji rendah, keluarganya di New York akan berada di jalanan jika dia dibiarkan tanpa pekerjaan baru. Valerio menerima hanya di bawah $ 20.000 untuk tiga bulan kerja. Akan tetapi, menurut laporan ombudsman, dia tidak berhak atas gaji tersebut karena dia bukan warga negara Timor Leste dan sudah tidak tinggal di negara itu setidaknya selama delapan tahun. Guterres menekankan bahwa Perdana Menteri Ramos-Horta saat itu menyetujui keputusan tersebut, begitu pula Sekretaris Jenderal dan Wakil Menteri Luar Negeri. Dia sendiri tidak melakukan kesalahan apa pun.[8] Ximenes dipekerjakan oleh pemerintah Alkatiri dan dekat dengan oposisi FRETILIN sekarang. Setelah beberapa tuduhan serupa terhadap berbagai anggota pemerintahan, Perdana Menteri Gusmão Ximenes menuding bias.[9]
Pada September 2010, Guterres dituduh menyalahgunakan jabatan dan korupsi oleh jaksa penuntut umum dan kemudian ditangguhkan dari jabatannya oleh Perdana Menteri Gusmão dan parlemen.[12] Latar belakang adalah tuduhan tentang pemberian jabatan diplomatik yang menguntungkan kepada istri Guterres.[13] Guterres menunjukkan bahwa istrinya telah menerima jabatan dari Wakil Menteri Luar Negeri Adaljíza Magno (FRETILIN) saat itu.[14] Pada tahun 2011, Perdana Menteri Gusmão menunjuk Emília Pires sebagai wakilnya saat dia dalam perjalanan bisnis ke luar negeri dari tanggal 1 hingga 11 Maret. José Luís Guterres seharusnya menghadapi persidangannya terlebih dahulu.[15] Prosesnya ditunda karena DPR belum mencabut kekebalan Guterres. Ini terjadi pada 6 April.[16][17][18][19][20] Pada tanggal 9 Mei, Guterres dibebaskan dari tuduhan oleh pengadilan.[21]
Pada tanggal 28 April 2011, FRETILIN Mudança didaftarkan sebagai pihak independen.[22] Persetujuan Pemilihan umum Parlemen Timor Leste 2012 akhirnya dilakukan pada bulan Agustus setelah perubahan nama menjadi Frenti-Mudança (FM).[23] Dalam Pemilihan umum Presiden Timor Leste 2012 pada 17 Maret Guterres maju sebagai kandidat dan gagal dengan 1,99% suara. Dalam pemilihan parlemen di Timor Timur tahun 2012, Frenti-Mudança berhasil masuk ke parlemen nasional dengan dua kursi. Guterres mencabut kursi parlemen untuk menjadi menteri luar negeri lagi per 8 Agustus 2012 dalam koalisi pemerintah dengan CNRT dan PD.
Saat perombakan pemerintahan pada 2015, Guterres kehilangan posisinya sebagai menteri luar negeri. Penggantinya adalah Hernâni Coelho. Guterres kembali ke parlemen nasional sebagai ketua grup FM.
Pada 6 November 2019, Dewan Menteri Timor Leste menunjuk Guterres sebagai Presiden baru Autoridade da Região Administrativa Especial de Oecusse (ARAEO).[25] Setelah mengkritik pemerintahannya dan pergeseran keseimbangan kekuasaan di pemerintahan ke-8, Guterres diberhentikan sebagai presiden pada 10 Juni 2020.[26]
Keluarga
Guterres menikah dengan Ana Maria Valerio dan memiliki dua anak. Adiknya Isabel Guterres telah menjadi Menteri Solidaritas Sosial sejak 2012.[27]