Archamoebae adalah sekelompok Amoebozoa[1] dibedakan oleh tidak adanya mitokondria.[2] Mereka termasuk genera yang merupakan parasit atau komensal internal hewan (Entamoeba dan Endolimax). Beberapa spesies merupakan patogen pada manusia, menyebabkan penyakit seperti disentri ameba. Genera lain dari archamoebae hidup di habitat air tawar, dan tidak biasa di antara ameba dalam memiliki flagela. Kebanyakan memiliki inti dan flagela tunggal, tetapi ameba raksasa Pelomyxa memiliki banyak inti dan flagela.