BM48-31病毒 (BtCoV/BM48-31/Rhi bla/Bulgaria/2008;BM48–31/BGR/2008)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 (SARSr-CoV)的一個病毒株,在保加利亞 布腊氏菊头蝠 的糞便樣本中發現,其基因組 已被完整定序,於2010年發表[ 1] 。
發現
2008年,研究人員在保加利亞 各地採集蝙蝠糞便樣本,經序列分析後發現多種冠狀病毒病毒株,其中屬於SARSr-CoV 的可分為兩支,一支皆感染地中海菊头蝠 ,另一支則包含感染布腊氏菊头蝠 、馬鐵菊頭蝠 與西班牙菊头蝠 的病毒株,有一布腊氏菊头蝠的病毒株被完整定序,即為BM48-31病毒[ 1] 。
BM48-31病毒的基因組 長29276nt [ 2] ,與其他SARSr-CoV相較之下,此病毒株缺乏ORF8 (2019年發表的肯亞BtKY72病毒 亦不具有ORF8[ 3] ),另外此病毒株的ORF3b和其他蝙蝠SARSr-CoV的一樣比SARS病毒 的短,不過相較於Rf1 等蝙蝠病毒ORF3b胺基酸 序列和SARS病毒的相似度超過90%,BM48-31病毒ORF3a胺基酸序列和SARS病毒的相似度僅有約45%[ 1] 。
分類
種系發生學 研究結果顯示BM48-31病毒與BtKY72病毒 組成一個演化支 ,兩者基因組序列相似度為81%[ 3] ,此演化支是SARSr-CoV 演化樹的基群 ,與其他SARSr-CoV分家早於SARS-CoV 和SARS-CoV-2 分家的時間[ 4] [ 5] 。
參考文獻
^ 1.0 1.1 1.2 Drexler JF, Gloza-Rausch F, Glende J, Corman VM, Muth D, Goettsche M; et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in European bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences. . J Virol. 2010, 84 (21): 11336–49. PMC 2953168 . PMID 20686038 . doi:10.1128/JVI.00650-10 .
^ Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome . NCBI . [2021-02-21 ] . (原始内容存档 于2022-03-29).
^ 3.0 3.1 Tao Y, Tong S. Complete Genome Sequence of a Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus from Kenyan Bats. . Microbiol Resour Announc. 2019, 8 (28). PMC 6624766 . PMID 31296683 . doi:10.1128/MRA.00548-19 .
^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. . Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. PMC 7159086 . PMID 32007145 . doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8 .
^ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. . Nat Microbiol. 2020, 5 (4): 536–544. PMC 7095448 . PMID 32123347 . doi:10.1038/s41564-020-0695-z .