Môn bóng đá tại Đại hội Thể thao Đông Nam Á 2009 bao gồm bóng đá nam và bóng đá nữ. Nội dung bóng đá nam diễn ra từ ngày 2 tháng 12 đến ngày 17 tháng 12 năm 2009 và nội dung bóng đá nữ diễn ra từ ngày 4 tháng 12 đến 16 tháng 12 năm 2009. Các trận đấu đều được tổ chức tại thủ đô Viêng Chăn của Lào. Độ tuổi tham dự giải đấu là U-23 đối với nam, và không giới hạn độ tuổi đối với nữ.
Năm đội tuyển thi đấu vòng tròn một lượt tính điểm, hai đội đứng đầu giành quyền thi đấu trận chung kết. Đội xếp thứ ba được trao huy chương đồng sau khi vòng bảng kết thúc.[3]