ZFY

ZFY
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KLR, 1KLS, 1XRZ, 5ZNF
Ідентифікатори
Символи	ZFY, ZNF911, zinc finger protein, Y-linked, zinc finger protein Y-linked
Зовнішні ІД	OMIM: 490000 HomoloGene: 88465 GeneCards: ZFY
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце Біологічний процес • multicellular organism development • transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7544	н/д
Ensembl	ENSG00000067646	н/д
UniProt	P08048	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001145275 NM_001145276 NM_003411	н/д
RefSeq (білок)	NP_001138747 NP_001138748 NP_003402 NP_001356631 NP_001356632 NP_001356633 NP_001356634 NP_001356635 NP_001356636 NP_001356637 NP_001356638 NP_001356639	н/д
Локус (UCSC)	Хр. Y: 2.94 – 2.98 Mb	н/д
PubMed search	[1]	н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

ZFY (англ. Zinc finger protein, Y-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 801 амінокислот, а молекулярна маса — 90 505[3].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDEDEFELQP		QEPNSFFDGI		GADATHMDGD		QIVVEIQEAV		FVSNIVDSDI
TVHNFVPDDP		DSVVIQDVVE		DVVIEEDVQC		SDILEEADVS		ENVIIPEQVL
DSDVTEEVSL		PHCTVPDDVL		ASDITSTSMS		MPEHVLTSES		MHVCDIGHVE
HMVHDSVVEA		EIITDPLTSD		IVSEEVLVAD		CAPEAVIDAS		GISVDQQDND
KASCEDYLMI		SLDDAGKIEH		DGSTGVTIDA		ESEMDPCKVD		STCPEVIKVY
IFKADPGEDD		LGGTVDIVES		EPENDHGVEL		LDQNSSIRVP		REKMVYMTVN
DSQQEDEDLN		VAEIADEVYM		EVIVGEEDAA		VAAAAAAVHE		QQIDEDEMKT
FVPIAWAAAY		GNNSDGIENR		NGTASALLHI		DESAGLGRLA		KQKPKKKRRP
DSRQYQTAII		IGPDGHPLTV		YPCMICGKKF		KSRGFLKRHM		KNHPEHLAKK
KYHCTDCDYT		TNKKISLHNH		LESHKLTSKA		EKAIECDECG		KHFSHAGALF
THKMVHKEKG		ANKMHKCKFC		EYETAEQGLL		NRHLLAVHSK		NFPHICVECG
KGFRHPSELR		KHMRIHTGEK		PYQCQYCEYR		SADSSNLKTH		IKTKHSKEMP
FKCDICLLTF		SDTKEVQQHT		LVHQESKTHQ		CLHCDHKSSN		SSDLKRHVIS
VHTKDYPHKC		EMCEKGFHRP		SELKKHVAVH		KGKKMHQCRH		CDFKIADPFV
LSRHILSVHT		KDLPFRCKRC		RKGFRQQNEL		KKHMKTHSGR		KVYQCEYCEY
STTDASGFKR		HVISIHTKDY		PHRCEYCKKG		FRRPSEKNQH		IMRHHKEVGL
P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Palmer M.S., Berta P., Sinclair A.H., Pym B., Goodfellow P.N. (1990). Comparison of human ZFY and ZFX transcripts. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 1681—1685. PMID 2308929 doi:10.1073/pnas.87.5.1681
• Erlandsson R., Wilson J.F., Paabo S. (2000). Sex chromosomal transposable element accumulation and male-driven substitutional evolution in humans. Mol. Biol. Evol. 17: 804—812. PMID 10779541 doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a026359
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Grants J., Flanagan E., Yee A., Romaniuk P.J. (2010). Characterization of the DNA binding activity of the ZFY zinc finger domain. Biochemistry. 49: 679—686. PMID 20028140 doi:10.1021/bi9018626
• Kochoyan M., Keutmann H.T., Weiss M.A. (1991). Alternating zinc fingers in the human male associated protein ZFY: refinement of the NMR structure of an even finger by selective deuterium labeling and implications for DNA recognition. Biochemistry. 30: 7063—7072. PMID 1854720 doi:10.1021/bi00243a005
• Lau Y.-F.C., Chan K. (1989). The putative testis-determining factor and related genes are expressed as discrete-sized transcripts in adult gonadal and somatic tissues. Am. J. Hum. Genet. 45: 942—952. PMID 2511751

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12870 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
3. UniProt, P08048 (англ.) . Архів оригіналу за 11 лютого 2017. Процитовано 13 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома Y

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»