uk TOP2B

TOP2B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3QX3, 4G0U, 4G0V, 4G0W, 4J3N
Ідентифікатори
Символи	TOP2B, TOPIIB, top2beta, topoisomerase (DNA) II beta, DNA topoisomerase II beta, BILU
Зовнішні ІД	OMIM: 126431 MGI: 98791 HomoloGene: 134711 GeneCards: TOP2B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0003918 DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity; • nucleotide binding; • DNA binding; • histone deacetylase binding; • chromatin binding; • isomerase activity; • зв'язування з іоном металу; • DNA topoisomerase activity; • protein C-terminus binding; • protein heterodimerization activity; • enzyme binding; • ATP binding; • protein kinase C binding; • ribonucleoprotein complex binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • нуклеоплазма; • GO:0035328 Гетерохроматин; • ядерце; • клітинне ядро; • цитоплазма; • Рибонуклеопротеїни; • viral integration complex;
Біологічний процес	• resolution of meiotic recombination intermediates; • аксоноґенеза; • DNA metabolic process; • neuron migration; • forebrain development; • mitotic DNA integrity checkpoint signaling; • sister chromatid segregation; • DNA topological change; • positive regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7155
	21974
	ENSG00000077097
	ENSMUSG00000017485
	Q02880
	Q64511
	NM_001068; NM_001330700
	NM_009409
	NP_001059; NP_001317629
	NP_033435
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TOP2B (англ. Topoisomerase (DNA) II beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 183 267^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKSGGCGAG	AGVGGGNGAL	TWVTLFDQNN	AAKKEESETA	NKNDSSKKLS
VERVYQKKTQ	LEHILLRPDT	YIGSVEPLTQ	FMWVYDEDVG	MNCREVTFVP
GLYKIFDEIL	VNAADNKQRD	KNMTCIKVSI	DPESNIISIW	NNGKGIPVVE
HKVEKVYVPA	LIFGQLLTSS	NYDDDEKKVT	GGRNGYGAKL	CNIFSTKFTV
ETACKEYKHS	FKQTWMNNMM	KTSEAKIKHF	DGEDYTCITF	QPDLSKFKME
KLDKDIVALM	TRRAYDLAGS	CRGVKVMFNG	KKLPVNGFRS	YVDLYVKDKL
DETGVALKVI	HELANERWDV	CLTLSEKGFQ	QISFVNSIAT	TKGGRHVDYV
VDQVVGKLIE	VVKKKNKAGV	SVKPFQVKNH	IWVFINCLIE	NPTFDSQTKE
NMTLQPKSFG	SKCQLSEKFF	KAASNCGIVE	SILNWVKFKA	QTQLNKKCSS
VKYSKIKGIP	KLDDANDAGG	KHSLECTLIL	TEGDSAKSLA	VSGLGVIGRD
RYGVFPLRGK	ILNVREASHK	QIMENAEINN	IIKIVGLQYK	KSYDDAESLK
TLRYGKIMIM	TDQDQDGSHI	KGLLINFIHH	NWPSLLKHGF	LEEFITPIVK
ASKNKQELSF	YSIPEFDEWK	KHIENQKAWK	IKYYKGLGTS	TAKEAKEYFA
DMERHRILFR	YAGPEDDAAI	TLAFSKKKID	DRKEWLTNFM	EDRRQRRLHG
LPEQFLYGTA	TKHLTYNDFI	NKELILFSNS	DNERSIPSLV	DGFKPGQRKV
LFTCFKRNDK	REVKVAQLAG	SVAEMSAYHH	GEQALMMTIV	NLAQNFVGSN
NINLLQPIGQ	FGTRLHGGKD	AASPRYIFTM	LSTLARLLFP	AVDDNLLKFL
YDDNQRVEPE	WYIPIIPMVL	INGAEGIGTG	WACKLPNYDA	REIVNNVRRM
LDGLDPHPML	PNYKNFKGTI	QELGQNQYAV	SGEIFVVDRN	TVEITELPVR
TWTQVYKEQV	LEPMLNGTDK	TPALISDYKE	YHTDTTVKFV	VKMTEEKLAQ
AEAAGLHKVF	KLQTTLTCNS	MVLFDHMGCL	KKYETVQDIL	KEFFDLRLSY
YGLRKEWLVG	MLGAESTKLN	NQARFILEKI	QGKITIENRS	KKDLIQMLVQ
RGYESDPVKA	WKEAQEKAAE	EDETQNQHDD	SSSDSGTPSG	PDFNYILNMS
LWSLTKEKVE	ELIKQRDAKG	REVNDLKRKS	PSDLWKEDLA	AFVEELDKVE
SQEREDVLAG	MSGKAIKGKV	GKPKVKKLQL	EETMPSPYGR	RIIPEITAMK
ADASKKLLKK	KKGDLDTAAV	KVEFDEEFSG	APVEGAGEEA	LTPSVPINKG
PKPKREKKEP	GTRVRKTPTS	SGKPSAKKVK	KRNPWSDDES	KSESDLEETE
PVVIPRDSLL	RRAAAERPKY	TFDFSEEEDD	DADDDDDDNN	DLEELKVKAS
PITNDGEDEF	VPSDGLDKDE	YTFSPGKSKA	TPEKSLHDKK	SQDFGNLFSF
PSYSQKSEDD	SAKFDSNEED	SASVFSPSFG	LKQTDKVPSK	TVAAKKGKPS
SDTVPKPKRA	PKQKKVVEAV	NSDSDSEFGI	PKKTTTPKGK	GRGAKKRKAS
GSENEGDYNP	GRKTSKTTSK	KPKKTSFDQD	SDVDIFPSDF	PTEPPSLPRT
GRARKEVKYF	AESDEEEDDV	DFAMFN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до ізомераз, топоізомераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Austin C.A., Sng J.H., Patel S., Fisher L.M. (1993). Novel HeLa topoisomerase II is the II beta isoform: complete coding sequence and homology with other type II topoisomerases. Biochim. Biophys. Acta. 1172: 283—291. PMID 8383537 doi:10.1016/0167-4781(93)90215-Y
Austin C.A., Fisher L.M. (1990). Isolation and characterization of a human cDNA clone encoding a novel DNA topoisomerase II homologue from HeLa cells. FEBS Lett. 266: 115—117. PMID 2163884 doi:10.1016/0014-5793(90)81520-X
Yuwen H., Hsia C.C., Nakashima Y., Evangelista A., Tabor E. (1997). Binding of wild-type p53 by topoisomerase II and overexpression of topoisomerase II in human hepatocellular carcinoma. Biochem. Biophys. Res. Commun. 234: 194—197. PMID 9168988 doi:10.1006/bbrc.1997.6539
Davies S.L., Jenkins J.R., Hickson I.D. (1993). Human cells express two differentially spliced forms of topoisomerase II beta mRNA. Nucleic Acids Res. 21: 3719—3723. PMID 8396237 doi:10.1093/nar/21.16.3719
Mirski S.E., Bielawski J.C., Cole S.P. (2003). Identification of functional nuclear export sequences in human topoisomerase IIalpha and beta. Biochem. Biophys. Res. Commun. 306: 905—911. PMID 12821127 doi:10.1016/S0006-291X(03)01077-5
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11990 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q02880 (англ.) . Архів оригіналу за 2 листопада 2017. Процитовано 30 серпня 2017.