SMARCA5
Ідентифікатори
Символи SMARCA5 Зовнішні ІД
OMIM : 603375 MGI: 1935129 HomoloGene: 55764 GeneCards: SMARCA5
Онтологія гена Молекулярна функція
• nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0031493 histone binding • GO:0102490, GO:0102491, GO:0102489, GO:0102488, GO:0102487, GO:0102486, GO:0102485 hydrolase activity, acting on acid anhydrides, in phosphorus-containing anhydrides • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • nucleosome binding • hydrolase activity • DNA binding • ATP binding • ATPase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • ATP-dependent activity, acting on DNA
Клітинна компонента
• RSF complex • nuclear replication fork • нуклеоплазма • condensed chromosome • клітинне ядро • fibrillar center • NURF complex • chromatin silencing complex • ISWI-type complex
Біологічний процес
• epigenetic maintenance of chromatin in transcription-competent conformation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly • DNA-templated transcription, initiation • nucleosome assembly • ремоделювання хроматину • rDNA heterochromatin assembly • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to leukemia inhibitory factor • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних Ортологи
Види
Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 4: 143.51 – 143.56 Mb Хр. 8: 81.43 – 81.47 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
SMARCA5 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. [ 3] амінокислот , а молекулярна маса — 121 905[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MSSAAEPPPP PPPESAPSKP AASIASGGSN SSNKGGPEGV AAQAVASAAS AGPADAEMEE IFDDASPGKQ KEIQEPDPTY EEKMQTDRAN RFEYLLKQTE LFAHFIQPAA QKTPTSPLKM KPGRPRIKKD EKQNLLSVGD YRHRRTEQEE DEELLTESSK ATNVCTRFED SPSYVKWGKL RDYQVRGLNW LISLYENGIN GILADEMGLG KTLQTISLLG YMKHYRNIPG PHMVLVPKST LHNWMSEFKR WVPTLRSVCL IGDKEQRAAF VRDVLLPGEW DVCVTSYEML IKEKSVFKKF NWRYLVIDEA HRIKNEKSKL SEIVREFKTT NRLLLTGTPL QNNLHELWSL LNFLLPDVFN SADDFDSWFD TNNCLGDQKL VERLHMVLRP FLLRRIKADV EKSLPPKKEV KIYVGLSKMQ REWYTRILMK DIDILNSAGK MDKMRLLNIL MQLRKCCNHP YLFDGAEPGP PYTTDMHLVT NSGKMVVLDK LLPKLKEQGS RVLIFSQMTR VLDILEDYCM WRNYEYCRLD GQTPHDERQD SINAYNEPNS TKFVFMLSTR AGGLGINLAT ADVVILYDSD WNPQVDLQAM DRAHRIGQTK TVRVFRFITD NTVEERIVER AEMKLRLDSI VIQQGRLVDQ NLNKIGKDEM LQMIRHGATH VFASKESEIT DEDIDGILER GAKKTAEMNE KLSKMGESSL RNFTMDTESS VYNFEGEDYR EKQKIAFTEW IEPPKRERKA NYAVDAYFRE ALRVSEPKAP KAPRPPKQPN VQDFQFFPPR LFELLEKEIL FYRKTIGYKV PRNPELPNAA QAQKEEQLKI DEAESLNDEE LEEKEKLLTQ GFTNWNKRDF NQFIKANEKW GRDDIENIAR EVEGKTPEEV IEYSAVFWER CNELQDIEKI MAQIERGEAR IQRRISIKKA LDTKIGRYKA PFHQLRISYG TNKGKNYTEE EDRFLICMLH KLGFDKENVY DELRQCIRNS PQFRFDWFLK SRTAMELQRR CNTLITLIER ENMELEEKEK AEKKKRGPKP STQKRKMDGA PDGRGRKKKL KL
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз , геліказ , регуляторів хроматину , фосфопротеїнів .
Задіяний у такому біологічному процесі як ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з АТФ , нуклеотидами .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Aalfs J.D., Narlikar G.J., Kingston R.E. (2001). Functional differences between the human ATP-dependent nucleosome remodeling proteins BRG1 and SNF2H. J. Biol. Chem . 276 : 34270—34278. PMID 11435432 doi :10.1074/jbc.M104163200 Bozhenok L., Wade P.A., Varga-Weisz P. (2002). WSTF-ISWI chromatin remodeling complex targets heterochromatic replication foci. EMBO J . 21 : 2231—2241. PMID 11980720 doi :10.1093/emboj/21.9.2231 Dirscherl S.S., Krebs J.E. (2004). Functional diversity of ISWI complexes . Biochem. Cell Biol . 82 : 482—489. PMID 15284901 doi :10.1139/o04-044 Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem . 281 : 16264—16271. PMID 16603771 doi :10.1074/jbc.M600233200
