SH2D3C

SH2D3C
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3T6G
Ідентифікатори
Символи	SH2D3C, Sh2d3c, Chat, Nsp3, Shep1, PRO34088, SH2 domain containing 3C
Зовнішні ІД	OMIM: 604722 MGI: 1351631 HomoloGene: 69145 GeneCards: SH2D3C
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана Біологічний процес • small GTPase mediated signal transduction • JNK cascade • positive regulation of signal transduction • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10044	27387
Ensembl	ENSG00000095370	ENSMUSG00000059013
UniProt	Q8N5H7	Q9QZS8
RefSeq (мРНК)	NM_001142531 NM_001142532 NM_001142533 NM_001142534 NM_001252334 NM_005489 NM_170600	NM_001252547 NM_013781
RefSeq (білок)	NP_001136003 NP_001136004 NP_001136005 NP_001136006 NP_001239263 NP_005480 NP_733745	NP_001239476 NP_038809
Локус (UCSC)	Хр. 9: 127.74 – 127.78 Mb	Хр. 2: 32.61 – 32.65 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SH2D3C (англ. SH2 domain containing 3C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 860 амінокислот, а молекулярна маса — 94 411[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEGTKKTSK		KFKFFKFKGF		GSLSNLPRSF		TLRRSSASIS		RQSHLEPDTF
EATQDDMVTV		PKSPPAYARS		SDMYSHMGTM		PRPSIKKAQN		SQAARQAQEA
GPKPNLVPGG		VPDPPGLEAA		KEVMVKATGP		LEDTPAMEPN		PSAVEVDPIR
KPEVPTGDVE		EERPPRDVHS		ERAAGEPEAG		SDYVKFSKEK		YILDSSPEKL
HKELEEELKL		SSTDLRSHAW		YHGRIPREVS		ETLVQRNGDF		LIRDSLTSLG
DYVLTCRWRN		QALHFKINKV		VVKAGESYTH		IQYLFEQESF		DHVPALVRYH
VGSRKAVSEQ		SGAIIYCPVN		RTFPLRYLEA		SYGLGQGSSK		PASPVSPSGP
KGSHMKRRSV		TMTDGLTADK		VTRSDGCPTS		TSLPRPRDSI		RSCALSMDQI
PDLHSPMSPI		SESPSSPAYS		TVTRVHAAPA		APSATALPAS		PVARRSSEPQ
LCPGSAPKTH		GESDKGPHTS		PSHTLGKASP		SPSLSSYSDP		DSGHYCQLQP
PVRGSREWAA		TETSSQQARS		YGERLKELSE		NGAPEGDWGK		TFTVPIVEVT
SSFNPATFQS		LLIPRDNRPL		EVGLLRKVKE		LLAEVDARTL		ARHVTKVDCL
VARILGVTKE		MQTLMGVRWG		MELLTLPHGR		QLRLDLLERF		HTMSIMLAVD
ILGCTGSAEE		RAALLHKTIQ		LAAELRGTMG		NMFSFAAVMG		ALDMAQISRL
EQTWVTLRQR		HTEGAILYEK		KLKPFLKSLN		EGKEGPPLSN		TTFPHVLPLI
TLLECDSAPP		EGPEPWGSTE		HGVEVVLAHL		EAARTVAHHG		GLYHTNAEVK
LQGFQARPEL		LEVFSTEFQM		RLLWGSQGAS		SSQARRYEKF		DKVLTALSHK
LEPAVRSSEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• Lu Y., Brush J., Stewart T.A. (1999). NSP1 defines a novel family of adaptor proteins linking integrin and tyrosine kinase receptors to the c-Jun N-terminal kinase/stress-activated protein kinase signaling pathway. J. Biol. Chem. 274: 10047—10052. PMID 10187783 DOI:10.1074/jbc.274.15.10047
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16884 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.
4. UniProt, Q8N5H7 (англ.) . Архів оригіналу за 29 серпня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»