PIWIL2

PIWIL2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3O7X, 3QIR
Ідентифікатори
Символи	PIWIL2, CT80, HILI, PIWIL1L, mili, piwi like RNA-mediated gene silencing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610312 MGI: 1930036 HomoloGene: 23071 GeneCards: PIWIL2
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • nucleic acid binding • piRNA binding • mRNA binding • nuclease activity • endonuclease activity • endoribonuclease activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • polysome binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • chromatoid body • Полісома • perinucleolar chromocenter • pi-body • P granule • dense body • PET complex • клітинне ядро Біологічний процес • germ-line stem cell population maintenance • диференціація клітин • positive regulation of histone H3-K9 acetylation • RNA 5'-end processing • positive regulation of meiosis I • positive regulation of translation • DNA methylation involved in gamete generation • Оогенез • multicellular organism development • GO:0007126 мейоз • positive regulation of histone H3-K14 acetylation • regulation of translation • piRNA metabolic process • Сайленсинг генів • Сперматогенез • negative regulation of transposition • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic • piRNA biosynthetic process • negative regulation of circadian rhythm • ритмічний процес Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55124	57746
Ensembl	ENSG00000197181	ENSMUSG00000033644
UniProt	Q8TC59	Q8CDG1
RefSeq (мРНК)	NM_001135721 NM_018068 NM_001330480	NM_021308 NM_001364321
RefSeq (білок)	NP_001129193 NP_001317409 NP_060538	NP_067283 NP_001351250
Локус (UCSC)	Хр. 8: 22.28 – 22.36 Mb	Хр. 14: 70.61 – 70.67 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PIWIL2 (англ. Piwi like RNA-mediated gene silencing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 973 амінокислот, а молекулярна маса — 109 849[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDPFRPSFRG		QSPIHPSQCQ		AVRMPGCWPQ		ASKPLDPALG		RGAPAGRGHV
FGKPEEPSTQ		RGPAQRESVG		LVSMFRGLGI		ETVSKTPLKR		EMLPSGRGIL
GRGLSANLVR		KDREELSPTF		WDPKVLAAGD		SKMAETSVGW		SRTLGRGSSD
ASLLPLGRAA		GGISREVDKP		PCTFSTPSRG		PPQLSSPPAL		PQSPLHSPDR
PLVLTVEHKE		KELIVKQGSK		GTPQSLGLNL		VKIQCHNEAV		YQYHVTFSPN
VECKSMRFGM		LKDHQAVTGN		VTAFDGSILY		LPVKLQQVLE		LKSQRKTDSA
EISIKIQMTK		ILEPCSDLCI		PFYNVVFRRV		MKLLDMKLVG		RNFYDPTSAM
VLQQHRLQIW		PGYAASIRRT		DGGLFLLADV		SHKVIRNDCV		LDVMHAIYQQ
NKEHFQDECT		KLLVGNIVIT		RYNNRTYRID		DVDWNKTPKD		SFTMSDGKEI
TFLEYYSKNY		GITVKEEDQP		LLIHRPSERQ		DNHGMLLKGE		ILLLPELSFM
TGIPEKMKKD		FRAMKDLAQQ		INLSPKQHHS		ALECLLQRIA		KNEAATNELM
RWGLRLQKDV		HKIEGRVLPM		ERINLKNTSF		ITSQELNWVK		EVTRDPSILT
IPMHFWALFY		PKRAMDQARE		LVNMLEKIAG		PIGMRMSPPA		WVELKDDRIE
TYVRTIQSTL		GAEGKIQMVV		CIIMGPRDDL		YGAIKKLCCV		QSPVPSQVVN
VRTIGQPTRL		RSVAQKILLQ		INCKLGGELW		GVDIPLKQLM		VIGMDVYHDP
SRGMRSVVGF		VASINLTLTK		WYSRVVFQMP		HQEIVDSLKL		CLVGSLKKFY
EVNHCLPEKI		VVYRDGVSDG		QLKTVANYEI		PQLQKCFEAF		ENYQPKMVVF
VVQKKISTNL		YLAAPQNFVT		PTPGTVVDHT		ITSCEWVDFY		LLAHHVRQGC
GIPTHYVCVL		NTANLSPDHM		QRLTFKLCHM		YWNWPGTIRV		PAPCKYAHKL
AFLSGHILHH		EPAIQLCENL		FFL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, білків розвитку, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, диференціація клітин, сперматогенез, РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг, метилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Sasaki T., Shiohama A., Minoshima S., Shimizu N. (2003). Identification of eight members of the Argonaute family in the human genome. Genomics. 82: 323—330. PMID 12906857 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00129-0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tian Y., Simanshu D.K., Ma J.B., Patel D.J. (2011). Structural basis for piRNA 2'-O-methylated 3'-end recognition by Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille) domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 903—910. PMID 21193640 DOI:10.1073/pnas.1017762108

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17644 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 19 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q8TC59 (англ.) . Архів оригіналу за 23 жовтня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 8

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»