uk NLRP3

NLRP3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3QF2, 2NAQ
Ідентифікатори
Символи	NLRP3, AGTAVPRL, AII, AVP, C1orf7, CIAS1, CLR1.1, FCAS, FCAS1, FCU, MWS, NALP3, PYPAF1, NLR family, pyrin domain containing 3, NLR family pyrin domain containing 3, DFNA34, KEFH
Зовнішні ІД	OMIM: 606416 MGI: 2653833 HomoloGene: 3600 GeneCards: NLRP3
Пов'язані генетичні захворювання
	Muckle-Wells syndrome, CINCA syndrome, autosomal dominant nonsyndromic deafness 34, familial cold autoinflammatory syndrome 4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• sequence-specific DNA binding; • nucleotide binding; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • peptidoglycan binding; • ATP binding; • identical protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • extracellular region; • ендоплазматичний ретикулум; • inflammasome complex; • клітинне ядро; • NLRP3 inflammasome complex; • Golgi membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана;
Біологічний процес	• defense response; • detection of biotic stimulus; • NLRP3 inflammasome complex assembly; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of acute inflammatory response; • positive regulation of interleukin-5 production; • interleukin-18 production; • процес імунної системи; • positive regulation of interleukin-4 production; • transcription, DNA-templated; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of interleukin-13 production; • positive regulation of T-helper 17 cell differentiation; • defense response to virus; • protein complex oligomerization; • positive regulation of T-helper 2 cell differentiation; • regulation of inflammatory response; • interleukin-1 beta production; • positive regulation of type 2 immune response; • inflammatory response; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • negative regulation of inflammatory response; • cellular response to lipopolysaccharide; • positive regulation of T-helper 2 cell cytokine production; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0097285 апоптоз; • вроджений імунітет; • protein deubiquitination; • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • cellular response to peptidoglycan; • negative regulation of NIK/NF-kappaB signaling;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	114548
	216799
	ENSG00000162711
	ENSMUSG00000032691
	Q96P20
	Q8R4B8
NM_001079821; NM_001127461; NM_001127462; NM_001243133; NM_004895;
	NM_183395
	NM_145827; NM_001359638
NP_001073289; NP_001120933; NP_001120934; NP_001230062; NP_004886;
	NP_899632
	NP_665826; NP_001346567
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NLRP3 (англ. NLR family pyrin domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 036 амінокислот, а молекулярна маса — 118 173^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKMASTRCKL	ARYLEDLEDV	DLKKFKMHLE	DYPPQKGCIP	LPRGQTEKAD
HVDLATLMID	FNGEEKAWAM	AVWIFAAINR	RDLYEKAKRD	EPKWGSDNAR
VSNPTVICQE	DSIEEEWMGL	LEYLSRISIC	KMKKDYRKKY	RKYVRSRFQC
IEDRNARLGE	SVSLNKRYTR	LRLIKEHRSQ	QEREQELLAI	GKTKTCESPV
SPIKMELLFD	PDDEHSEPVH	TVVFQGAAGI	GKTILARKMM	LDWASGTLYQ
DRFDYLFYIH	CREVSLVTQR	SLGDLIMSCC	PDPNPPIHKI	VRKPSRILFL
MDGFDELQGA	FDEHIGPLCT	DWQKAERGDI	LLSSLIRKKL	LPEASLLITT
RPVALEKLQH	LLDHPRHVEI	LGFSEAKRKE	YFFKYFSDEA	QARAAFSLIQ
ENEVLFTMCF	IPLVCWIVCT	GLKQQMESGK	SLAQTSKTTT	AVYVFFLSSL
LQPRGGSQEH	GLCAHLWGLC	SLAADGIWNQ	KILFEESDLR	NHGLQKADVS
AFLRMNLFQK	EVDCEKFYSF	IHMTFQEFFA	AMYYLLEEEK	EGRTNVPGSR
LKLPSRDVTV	LLENYGKFEK	GYLIFVVRFL	FGLVNQERTS	YLEKKLSCKI
SQQIRLELLK	WIEVKAKAKK	LQIQPSQLEL	FYCLYEMQEE	DFVQRAMDYF
PKIEINLSTR	MDHMVSSFCI	ENCHRVESLS	LGFLHNMPKE	EEEEEKEGRH
LDMVQCVLPS	SSHAACSHGL	VNSHLTSSFC	RGLFSVLSTS	QSLTELDLSD
NSLGDPGMRV	LCETLQHPGC	NIRRLWLGRC	GLSHECCFDI	SLVLSSNQKL
VELDLSDNAL	GDFGIRLLCV	GLKHLLCNLK	KLWLVSCCLT	SACCQDLASV
LSTSHSLTRL	YVGENALGDS	GVAILCEKAK	NPQCNLQKLG	LVNSGLTSVC
CSALSSVLST	NQNLTHLYLR	GNTLGDKGIK	LLCEGLLHPD	CKLQVLELDN
CNLTSHCCWD	LSTLLTSSQS	LRKLSLGNND	LGDLGVMMFC	EVLKQQSCLL
QNLGLSEMYF	NYETKSALET	LQEEKPELTV	VFEPSW

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, запальна відповідь. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі. Також секретований назовні.

Література

Hoffman H.M., Mueller J.L., Broide D.H., Wanderer A.A., Kolodner R.D. (2001). Mutation of a new gene encoding a putative pyrin-like protein causes familial cold autoinflammatory syndrome and Muckle-Wells syndrome. Nat. Genet. 29: 301—305. PMID 11687797 doi:10.1038/ng756
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
O'Connor W. Jr., Harton J.A., Zhu X., Linhoff M.W., Ting J.-P. (2003). CIAS1/cryopyrin/PYPAF1/NALP3/CATERPILLER 1.1 is an inducible inflammatory mediator with NF-kappa B suppressive properties. J. Immunol. 171: 6329—6333. PMID 14662828 doi:10.4049/jimmunol.171.12.6329
Haneklaus M., O'Neill L.A., Coll R.C. (2013). Modulatory mechanisms controlling the NLRP3 inflammasome in inflammation: recent developments. Curr. Opin. Immunol. 25: 40—45. PMID 23305783 doi:10.1016/j.coi.2012.12.004
Lu A., Wu H. (2015). Structural mechanisms of inflammasome assembly. FEBS J. 282: 435—444. PMID 25354325 doi:10.1111/febs.13133
Bae J.Y., Park H.H. (2011). Crystal structure of NALP3 protein pyrin domain (PYD) and its implications in inflammasome assembly. J. Biol. Chem. 286: 39528—39536. PMID 21880711 doi:10.1074/jbc.M111.278812