MMP20

MMP20
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JSD
Ідентифікатори
Символи	MMP20, AI2A2, MMP-20, matrix metallopeptidase 20
Зовнішні ІД	OMIM: 604629 MGI: 1353466 HomoloGene: 21001 GeneCards: MMP20
Пов'язані генетичні захворювання
amelogenesis imperfecta hypomaturation type 2A2, hypomaturation amelogenesis imperfecta[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • serine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • collagen catabolic process • GO:0044257 protein catabolic process • regulation of enamel mineralization • протеоліз • amelogenesis • extracellular matrix disassembly • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9313	30800
Ensembl	ENSG00000137674	ENSMUSG00000018620
UniProt	O60882	P57748
RefSeq (мРНК)	NM_004771	NM_013903
RefSeq (білок)	NP_004762	NP_038931
Локус (UCSC)	Хр. 11: 102.58 – 102.63 Mb	Хр. 9: 7.63 – 7.67 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP20 (англ. Matrix metallopeptidase 20) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 54 387[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVLPASGLA		VFLIMALKFS		TAAPSLVAAS		PRTWRNNYRL		AQAYLDKYYT
NKEGHQIGEM		VARGSNSMIR		KIKELQAFFG		LQVTGKLDQT		TMNVIKKPRC
GVPDVANYRL		FPGEPKWKKN		TLTYRISKYT		PSMSSVEVDK		AVEMALQAWS
SAVPLSFVRI		NSGEADIMIS		FENGDHGDSY		PFDGPRGTLA		HAFAPGEGLG
GDTHFDNAEK		WTMGTNGFNL		FTVAAHEFGH		ALGLAHSTDP		SALMYPTYKY
KNPYGFHLPK		DDVKGIQALY		GPRKVFLGKP		TLPHAPHHKP		SIPDLCDSSS
SFDAVTMLGK		ELLLFKDRIF		WRRQVHLRTG		IRPSTITSSF		PQLMSNVDAA
YEVAERGTAY		FFKGPHYWIT		RGFQMQGPPR		TIYDFGFPRH		VQQIDAAVYL
REPQKTLFFV		GDEYYSYDER		KRKMEKDYPK		NTEEEFSGVN		GQIDAAVELN
GYIYFFSGPK		TYKYDTEKED		VVSVVKSSSW		IGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з MMP20 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7167 (англ.) . Архів оригіналу за 26 березня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-03-26 у Wayback Machine.]
5. UniProt, O60882 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 11

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»