ADAMTS4

ADAMTS4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RJP, 3B2Z, 4WK7, 4WKE, 4WKI
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS4, ADAMTS-2, ADAMTS-4, ADMP-1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4
Зовнішні ІД	OMIM: 603876 MGI: 1339949 HomoloGene: 36169 GeneCards: ADAMTS4
Онтологія гена Молекулярна функція • protease binding • GO:0070122 peptidase activity • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • metalloendopeptidase activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • nuclear speck • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • skeletal system development • extracellular matrix disassembly • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9507	240913
Ensembl	ENSG00000158859	ENSMUSG00000006403
UniProt	O75173	Q8BNJ2
RefSeq (мРНК)	NM_005099 NM_001320336	NM_172845
RefSeq (білок)	NP_001307265 NP_005090	NP_766433
Локус (UCSC)	Хр. 1: 161.18 – 161.2 Mb	Хр. 1: 171.08 – 171.09 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS4 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 837 амінокислот, а молекулярна маса — 90 197[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQTGSHPGR		GLAGRWLWGA		QPCLLLPIVP		LSWLVWLLLL		LLASLLPSAR
LASPLPREEE		IVFPEKLNGS		VLPGSGAPAR		LLCRLQAFGE		TLLLELEQDS
GVQVEGLTVQ		YLGQAPELLG		GAEPGTYLTG		TINGDPESVA		SLHWDGGALL
GVLQYRGAEL		HLQPLEGGTP		NSAGGPGAHI		LRRKSPASGQ		GPMCNVKAPL
GSPSPRPRRA		KRFASLSRFV		ETLVVADDKM		AAFHGAGLKR		YLLTVMAAAA
KAFKHPSIRN		PVSLVVTRLV		ILGSGEEGPQ		VGPSAAQTLR		SFCAWQRGLN
TPEDSDPDHF		DTAILFTRQD		LCGVSTCDTL		GMADVGTVCD		PARSCAIVED
DGLQSAFTAA		HELGHVFNML		HDNSKPCISL		NGPLSTSRHV		MAPVMAHVDP
EEPWSPCSAR		FITDFLDNGY		GHCLLDKPEA		PLHLPVTFPG		KDYDADRQCQ
LTFGPDSRHC		PQLPPPCAAL		WCSGHLNGHA		MCQTKHSPWA		DGTPCGPAQA
CMGGRCLHMD		QLQDFNIPQA		GGWGPWGPWG		DCSRTCGGGV		QFSSRDCTRP
VPRNGGKYCE		GRRTRFRSCN		TEDCPTGSAL		TFREEQCAAY		NHRTDLFKSF
PGPMDWVPRY		TGVAPQDQCK		LTCQAQALGY		YYVLEPRVVD		GTPCSPDSSS
VCVQGRCIHA		GCDRIIGSKK		KFDKCMVCGG		DGSGCSKQSG		SFRKFRYGYN
NVVTIPAGAT		HILVRQQGNP		GHRSIYLALK		LPDGSYALNG		EYTLMPSPTD
VVLPGAVSLR		YSGATAASET		LSGHGPLAQP		LTLQVLVAGN		PQDTRLRYSF
FVPRPTPSTP		RPTPQDWLHR		RAQILEILRR		RPWAGRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Wainwright S.D., Bondeson J., Hughes C.E. (2006). An alternative spliced transcript of ADAMTS4 is present in human synovium from OA patients. Matrix Biol. 25: 317—320. PMID 16723216 DOI:10.1016/j.matbio.2006.03.006
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wainwright S.D., Bondeson J., Caterson B., Hughes C.E. (2013). ADAMTS-4_v1 is a splice variant of ADAMTS-4 that is expressed as a protein in human synovium and cleaves aggrecan at the interglobular domain. Arthritis Rheum. 65: 2866—2875. PMID 23897278 DOI:10.1002/art.38102

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:220 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, O75173 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 1

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»