ADAMTS5

ADAMTS5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RJQ, 3B8Z, 3HY7, 3HY9, 3HYG, 3LJT
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS5, ADAM-TS 11, ADAM-TS 5, ADAM-TS5, ADAMTS-11, ADAMTS-5, ADAMTS11, ADMP-2, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5
Зовнішні ІД	OMIM: 605007 MGI: 1346321 HomoloGene: 5109 GeneCards: ADAMTS5
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • zinc ion binding • extracellular matrix binding • зв'язування з іоном металу • integrin binding • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity Клітинна компонента • endoplasmic reticulum lumen • extracellular region • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • extracellular matrix disassembly • протеоліз • defense response to bacterium • Прорізування зубів • negative regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11096	23794
Ensembl	ENSG00000154736	ENSMUSG00000022894
UniProt	Q9UNA0	Q9R001
RefSeq (мРНК)	NM_007038	NM_011782
RefSeq (білок)	NP_008969	NP_035912
Локус (UCSC)	Хр. 21: 26.92 – 26.97 Mb	Хр. 16: 85.65 – 85.7 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS5 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 930 амінокислот, а молекулярна маса — 101 718[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLGWASLLL		CAFRLPLAAV		GPAATPAQDK		AGQPPTAAAA		AQPRRRQGEE
VQERAEPPGH		PHPLAQRRRS		KGLVQNIDQL		YSGGGKVGYL		VYAGGRRFLL
DLERDGSVGI		AGFVPAGGGT		SAPWRHRSHC		FYRGTVDGSP		RSLAVFDLCG
GLDGFFAVKH		ARYTLKPLLR		GPWAEEEKGR		VYGDGSARIL		HVYTREGFSF
EALPPRASCE		TPASTPEAHE		HAPAHSNPSG		RAALASQLLD		QSALSPAGGS
GPQTWWRRRR		RSISRARQVE		LLLVADASMA		RLYGRGLQHY		LLTLASIANR
LYSHASIENH		IRLAVVKVVV		LGDKDKSLEV		SKNAATTLKN		FCKWQHQHNQ
LGDDHEEHYD		AAILFTREDL		CGHHSCDTLG		MADVGTICSP		ERSCAVIEDD
GLHAAFTVAH		EIGHLLGLSH		DDSKFCEETF		GSTEDKRLMS		SILTSIDASK
PWSKCTSATI		TEFLDDGHGN		CLLDLPRKQI		LGPEELPGQT		YDATQQCNLT
FGPEYSVCPG		MDVCARLWCA		VVRQGQMVCL		TKKLPAVEGT		PCGKGRICLQ
GKCVDKTKKK		YYSTSSHGNW		GSWGSWGQCS		RSCGGGVQFA		YRHCNNPAPR
NNGRYCTGKR		AIYRSCSLMP		CPPNGKSFRH		EQCEAKNGYQ		SDAKGVKTFV
EWVPKYAGVL		PADVCKLTCR		AKGTGYYVVF		SPKVTDGTEC		RLYSNSVCVR
GKCVRTGCDG		IIGSKLQYDK		CGVCGGDNSS		CTKIVGTFNK		KSKGYTDVVR
IPEGATHIKV		RQFKAKDQTR		FTAYLALKKK		NGEYLINGKY		MISTSETIID
INGTVMNYSG		WSHRDDFLHG		MGYSATKEIL		IVQILATDPT		KPLDVRYSFF
VPKKSTPKVN		SVTSHGSNKV		GSHTSQPQWV		TGPWLACSRT		CDTGWHTRTV
QCQDGNRKLA		KGCPLSQRPS		AFKQCLLKKC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hurskainen T.L., Hirohata S., Seldin M.F., Apte S.S. (1999). ADAM-TS5, ADAM-TS6, and ADAM-TS7, novel members of a new family of zinc metalloproteases. J. Biol. Chem. 274: 25555—25563. PMID 10464288 DOI:10.1074/jbc.274.36.25555
• Wang L.W., Leonhard-Melief C., Haltiwanger R.S., Apte S.S. (2009). Post-translational modification of thrombospondin type-1 repeats in ADAMTS-like 1/punctin-1 by C-mannosylation of tryptophan. J. Biol. Chem. 284: 30004—30015. PMID 19671700 DOI:10.1074/jbc.M109.038059

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:221 (англ.) . Архів оригіналу за 28 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-28 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9UNA0 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 21

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»