ARNT2
Ідентифікатори
Символи ARNT2 Зовнішні ІД
OMIM : 606036 MGI: 107188 HomoloGene: 7230 GeneCards: ARNT2
Онтологія гена Молекулярна функція
• DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • aryl hydrocarbon receptor binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• response to estradiol • response to hypoxia • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of apoptotic process • in utero embryonic development • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • central nervous system development • brain development • positive regulation of cell population proliferation • xenobiotic metabolic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних Ортологи
Види
Людина Миша Entrez Ensembl UniProt RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 15: 80.4 – 80.6 Mb Хр. 7: 83.9 – 84.06 Mb PubMed search[ 1] [ 2] Вікідані
ARNT2 (англ. Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.[ 3] амінокислот , а молекулярна маса — 78 691[ 4]
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50 MATPAAVNPP EMASDIPGSV TLPVAPMAAT GQVRMAGAMP ARGGKRRSGM DFDDEDGEGP SKFSRENHSE IERRRRNKMT QYITELSDMV PTCSALARKP DKLTILRMAV SHMKSMRGTG NKSTDGAYKP SFLTEQELKH LILEAADGFL FVVAAETGRV IYVSDSVTPV LNQPQSEWFG STLYEQVHPD DVEKLREQLC TSENSMTGRI LDLKTGTVKK EGQQSSMRMC MGSRRSFICR MRCGNAPLDH LPLNRITTMR KRFRNGLGPV KEGEAQYAVV HCTGYIKAWP PAGMTIPEED ADVGQGSKYC LVAIGRLQVT SSPVCMDMNG MSVPTEFLSR HNSDGIITFV DPRCISVIGY QPQDLLGKDI LEFCHPEDQS HLRESFQQVV KLKGQVLSVM YRFRTKNREW MLIRTSSFTF QNPYSDEIEY IICTNTNVKQ LQQQQAELEV HQRDGLSSYD LSQVPVPNLP AGVHEAGKSV EKADAIFSQE RDPRFAEMFA GISASEKKMM SSASAAGTQQ IYSQGSPFPS GHSGKAFSSS VVHVPGVNDI QSSSSTGQNM SQISRQLNQS QVAWTGSRPP FPGQQIPSQS SKTQSSPFGI GTSHTYPADP SSYSPLSSPA TSSPSGNAYS SLANRTPGFA ESGQSSGQFQ GRPSEVWSQW QSQHHGQQSG EQHSHQQPGQ TEVFQDMLPM PGDPTQGTGN YNIEDFADLG MFPPFSE
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Barrow L.L., Wines M.E., Romitti P.A., Holdener B.C., Murray J.C. (2002). Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 (ARNT2): structure, gene mapping, polymorphisms, and candidate evaluation for human orofacial clefts. Teratology . 66 : 85—90. PMID 12210012 doi :10.1002/tera.10062 The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504 Bersten D.C., Bruning J.B., Peet D.J., Whitelaw M.L. (2014). Human variants in the neuronal basic helix-loop-helix/Per-Arnt-Sim (bHLH/PAS) transcription factor complex NPAS4/ARNT2 disrupt function. PLoS ONE . 9 : E85768—E85768. PMID 24465693 doi :10.1371/journal.pone.0085768
