Музей був заснований 28 жовтня 1987 року з нагоди святкування 750-річного ювілею Берліна і у той час розміщувався у будівлі Рейхстагу у Західному Берліні. Цього дня відповідна угода була підписана федеральним канцлером Гельмутом Колем і керівним бургомістромЗахідного БерлінаЕберхардом Діпгеном у будівлі рейхстагу. Перша постійна виставка «Картини і свідоцтва німецької історії» відкрилася у грудні 1994 року і включала понад 2 000 експонатів.
Німецький історичний музей передбачалося розмістити у спеціально для нього побудованому будинку недалеко від рейхстагу. В архітектурному конкурсі на проєкт нової музейної будівлі переміг італійський архітектор Альдо Россі. Падіння Берлінської стіни внесло свої корективи в ці плани. Після об'єднання Німеччини 3 жовтня 1990 року федеральний уряд передав Німецькому історичному музею колекцію і площі Музею німецької історії, того, що функціював у НДР. Так Цейхгауз, найстаріша будівля, на Унтер-ден-Лінден став будинком для Німецького історичного музею. Перші експозиції в Цейхгаузі відкрилися вже у вересні 1991 року.
У 1998 році розпочалася реставрація Цейхгаузу. Фоє та внутрішній дворик відкрилися у квітні 2004 року. Постійна експозиція музею відкрилася 2 червня 2006 року в присутності федерального канцлераАнгели Меркель. З 2003 року був відкритий доступ відвідувачів до другого будинку музею, побудованого Бей Юйміном, де проходять спеціалізовані виставки.
Німецький історичний музей одним з перших музеїв Німеччини відкрив власний вебсайт, який перетворився на один з найпопулярніших музейних сайтів у Німеччині. Німецький історичний музей — один з найвідвідуваніших музеїв Німеччини.
Виставки
Постійна експозиція музею включає понад 8 000 історичних експонатів, що оповідають про осіб, події, ідеї і процеси майже у двотисячолітній німецькій історії: від першого століття до н. е. і до нинішніх днів.
Чотири поверхи виставкового залу Бей Юйміна переважно використовуються для спеціальних виставок музею.
Керівництво музею
Генеральні директори Музею або Президенти Фонду:
1987–1999: Крістоф Штельцль
2000–2011: Ганс Оттомаєр
2011–2016: Александр Кох
з 1 квітня 2017 року: Рафаель Гросс
Колекції
Повсякденна культура з такими підтемами
Відзнаки, повсякденна історія, сільське господарство, політика, релігія, іграшки, історія техніки та медицини, звукозаписи, цивільний одяг і текстиль: близько 130 000 предметів [2]
Рукописи – стародруки та цінні друки
близько 35 000 об'єктів
Прикладне мистецтво та графіка
Декоративно-прикладне мистецтво, скульптура до 1900 р., графіка: бл. 10300 предметів [3]
Зображення
Плакати, фотоколекція, архів зображень, листівки: бл.300 тис. об’єктів [4]
Документи
Історичні першоджерела та документи від раннього середньовіччя до початку Першої світової війни (від IX ст. до 1914 р.), документи з 1900 р., нумізматика : бл. 284 000 предметів [5]
Christoph Stölzl: Deutsches Historisches Museum.Ideen – Kontroversen – Perspektiven. Frankfurt am Main/Berlin 1988, ISBN 3-549-06682-1.
Deutsches Historisches Museum Berlin. Aldo Rossis Entwurf im Gefüge der Kulturformen, ISBN 3-421-03004-9.
Mathias Wallner, Heike Werner: Architektur und Geschichte in Deutschland. S. 162–163, Werner, München 2006, ISBN 3-9809471-1-4.
Jürgen Kocka: Ein chronologischer Bandwurm.Die Dauerausstellung des Deutschen Historischen Museums. In: Geschichte und Gesellschaft Jg. 32/2006. S. 398–411.
Ulrike Kretzschmar (Hrsg.): Das Berliner Zeughaus.Vom Waffenarsenal zum Deutschen Historischen Museum. The Berlin Armoury. From the Arsenal to the German Historical Museum. München/Berlin/London/New York, Prestel Verlag 2006. 112 S., zahlr. farb. Abb., ISBN 3-7913-3356-9.
Heinrich Müller, Hartmut Kölling: Europäische Hieb- und Stichwaffen. aus der Sammlung des Museums für Deutsche Geschichte Berlin, Militärverlag der Deutschen Demokratischen Republik 1981, 2. Aufl. 1982, 448 S., zahlr. farb. und s/w Abb., fotografiert von Gerd Platow, Bestellnummer: 746 245 6, nur antiquarisch erhältlich (behandelt den Bestand des Vorgängermuseums)
Ruth Rosenberger: Neues LeMO.Das Online-Portal zur deutschen Geschichte. In: Stiftung Haus der Geschichte der Bundesrepublik Deutschland: museumsmagazin, Jg. 3/2014, S. 20–26. (PDF).