18 червня 2004 Гербера обміняла на гравця «Кароліна Гаррікейнс» та вибір у драфті НХЛ 2004.[2] Під час локауту НХЛ у сезоні 2004–05 Мартін виступав у Європі за клуби «Лангнау Тайгерс» та «Фер'єстад».
1 липня 2006 Гербер, як вільний агент уклав контракт з клубом «Оттава Сенаторс».[5] У сезоні 2006–07 «сенатори» вийшли в фінал Кубка Стенлі, де поступились колишньому клубові швейцарця «Анагайм Дакс». Цей фінал став третім для Мартіна за останні п'ять років.[6] Початок сезону 2007–08 Гербер провів, який перший номер але згодом Рей Емері повернув собі місце в основі. У сезоні 2008–09 був дублером Алекса Олда, а 22 січня 2009 його взагалі відправили до фарм-клубу «Бінгхемптон Сенаторс».[7]
У міжсезоння Гербер підписав контракт з російським клубом «Атлант» (Митищі). 13 грудня 2009 під час гри воротар отримав забій хребта та вибув на кілька тижнів.[9]
6 серпня 2010 Гербер уклав однорічний контракт з «Едмонтон Ойлерс».[10] 18 листопада його викликали з «Оклахома Сіті Беронс» для заміни травмованого Миколи Хабібуліна.[11] 25 листопада Мартін відіграв першу гру за «нафтовиків» та записав перемогу 3–2 над «Колорадо Аваланч».
12 липня 2011 Гербер підписав річний контракт з шведським клубом «Векше Лейкерс»,[12] наступний сезон він відіграв за іншу шведську команду «Регле».[13] Завершив свою кар'єру виступами за швейцарський «Клотен Флаєрс».
Загалом провів 241 матч у НХЛ, включаючи 12 ігор плей-оф Кубка Стенлі.
Виступав за збірну Швейцарії, на головних турнірах світового хокею провів 52 гри в її складі.[14]