День, рік і місто народження Дірка ван Бабюрена невідомі. Приблизно його відносять до 1595 року. Вже у 1611 році згадується в записах у гільдії Св. Луки Утрехта, що давало право на фахову діяльність. Його вчителем був Паулюс Морелсе (1571—1638), декан гільдії художників міста Утрехт. Художник і архітектор, Морелсе був в Італії і міг багато чому навчити молодого Бабюрена.
Приблизно з 1612 року Бабюрен в Римі. Твори на біблійні теми і роботи в римських церквах доводять, що родина і сам Бабюрен були католиками. Молодий художник привернув до себе увагу особистого лікаря папи римського Урбана VIIIДжуліо Манчіні і той писав про Бабюрена в своїй книзі" Considerazioni sulla Pittura "(Думки про живопис).Автор розповів про роботу Бабюрена в каплиці однієї з церков Риму.. Меценатом молодого художника був і маркіз Вінченцо Джустініані. Художня манера Бабюрена склалась під впливом Караваджо і його римських послідовників. Роботи римського періоду більш старанні і добре виписані, але далекі від витонченості і шляхетності творів Ніколо Реньєрі чи Валантена де Булонь. В Римі жив в приході церкви Сан Андреа делле Фрате, добре обжитому художниками.
Через 8 років Бабюрен повернувся в Утрехт. Батьківщина зустріла хворобою батька і його смертю. Після похорон займався справами родини і багато працював як художник. Створив для аристократа Фредеріка Хендріка Оранського декілька портретів римських імператорів. В лютому 1624 року Бабюрен помер.