I januari 2016 började Miller arbeta som rådgivare inom Donald Trumps presidentkampanj i presidentvalet 2016.[2] Efter Trumps seger i presidentvalet utsågs Miller och Jared Kushner till Senior Advisors (seniorrådgivare) till president Trump i hans kabinett som tillträdde den 20 januari 2017.[3][4]
I september 2017 rapporterade The New York Times att Miller stoppade Trump-administrationen från att visa för allmänheten en intern studie av USA:s hälso- och socialdepartement som fann att flyktingar hade en positiv nettoeffekt på statens intäkter. Miller insisterade på att bara kostnaderna av flyktingar skulle publiceras, inte de intäkter som flyktingar tog in.[5]