В игре можно свободно путешествовать по всем землям Хогвартса и применять на любой объект заклинания, подобно своему предшественнику Ордену Феникса. В игре также присутствует многопользовательский режим (в главном меню можно выбрать как одиночную, так и многопользовательскую игру), уроки, четыре времени суток (утро, день, вечер, ночь), квиддич, дуэли волшебников (один или два игрока) и зельеварение.
Платформы
Версии игры на разные платформы значительно отличаются. Ниже приведено краткое описание игры на разные платформы
Wii
Целевой платформой для разработки игры была Wii, поэтому всё управление изначально было приспособлено для Wii Remote. Версии для остальных платформ были портированы с Wii.
Не так, как прежде, во время хождения по Хогвартсу, сенсор пульта Wii remote может быть использован для управления камерой (для этого надо задерживать клавишу B).
Управление навыками также претерпело изменения. Вингардиум Левиоса теперь выполняется с помощью кнопки B, пульт Wii Remote начнет летать вокруг вас. Левитированные объекты управляются аналоговым контроллером нунчака.
Nintendo DS
В версии для DS вы можете использовать стилус на некоторых моментах, чтобы творить заклинания, такие как Левикорпус, Вингардиум Левиоса и прочие. Также можно изготовлять зелья для профессора Слизнорта и сражаться с Дементорами. Также можно играть в мини-игры, такие как шахматы и плюй-камни. Также в версии Nintendo DS можно исполнять заклинания, используя встроенный микрофон консоли.
PS2-версия использует такое же управление, как и в предыдущих сериях игры.
Xbox 360
В версии для Xbox 360 использовано такое же управление, как и в предыдущих сериях игры (волшебной палочкой служат левый и правый стики).
ПК
Используется такое же управление, как и в Ордене Феникса (волшебной палочкой служит мышка).
Локации
Как и в Ордене Феникса, игрок может свободно бродить по Хогвартсу. Ключевыми локациями (которые можно посетить) в игре являются астрономическая башня, Нора и пещера, в которой хранится крестраж. Также в игре можно посетить новые локации, такие, как Поле для Квиддича, кабинет Дамблдора, Кабинет профессора Горация Слизнорта, усовершенствованные теплицы, Дуэльный клуб (Большой зал превращается в дуэльный клуб) и т. д., но нельзя будет посетить Выручай-комнату и кабинет защиты от темных искусств.
Сюжет игры в целом повторяет одноименный фильм – Дамблдор готовит Гарри к окончательной битве против Волан-де-Морта, который усиливает свой контроль над мирами магов и маглов. Вместе они ищут и уничтожают крестражи, чтобы уничтожить Волан-де-Морта; с этой же целью Дамблдор приглашает на работу старого друга и коллегу Горация Слизнорта, который владеет важной информацией.