Компания Hapag-Lloyd Flug была основана в июле 1972 года, когда транспортная компания Hapag-Lloyd купила Boeing 727 для перевозки своих пассажиров из Германии в порты, из которых следуют круизные лайнеры. Авиакомпания начал свою деятельность 30 марта 1973 года. Рынок чартерных рейсов в 1970-х годах быстро развивался. Компания быстро освоила чартерные рейсы в популярные места отдыха в районе Средиземного моря и на Канарских островах, а также вскоре стала одной из крупнейших немецких чартерных авиакомпаний. Также авиакомпания развивала и регулярные пассажирские рейсы, а также пополняла парк новыми самолётами, такими как Boeing 737-100 и Airbus A310. В 1979 году чартерный авиаперевозчик Bavaria Germanair[англ.], эксплуатирующий самолеты Airbus A300B4 и BAC 1-11, была объединёна с Hapag-Lloyd Flug.
Поглощение и ребрендинг
С 1997 года авиакомпания является дочерней компанией TUI AG, в которую также входит Hapag-Lloyd. Впервые за почти 30 лет деятельности авиакомпании изменила ливрею и логотип. В 2002 году также была основана бюджетная авиакомпанияHapag-Lloyd Express[англ.].
В 1998 году Hapag-Lloyd Flug стала первой авиакомпанией в мире, эксплуатирующей Boeing 737-800.
В ноябре 2005 года авиакомпания сменила название на Hapagfly в связи с новой маркетинговой стратегией группы TUI. В январе 2007 года в ходе реструктуризации компания объединилась с Hapag-Lloyd Express, став TUIfly Deutschland[3].
12 июля 2000 года Airbus A310 авиакомпании Hapag-Lloyd Airbus, летевший из Ханьи в Ганновер, столкнулся с нехваткой топлива и неисправностью шасси, что привело к аварийной посадке в аэропорту Вены. 26 человек получили ранения, самолёт был списан[5]. Несмотря на то, что это был первый (и единственный[6]) авиаинцидент в истории Hapag-Lloyd, при котором был повреждён самолет и были ранены люди, он вызвал много критики в средствах массовой информации. В 2004 году окружной суд Ганновера признал капитана Вольфганга Армингера виновным в происшествии и приговорил его к шестимесячному тюремному заключению условно[7].