По некоторым данным храм построен к 1429 году. Впервые упоминается в 1476 году в книге «Деяние Святой Библии», написанной отцом Меликсетом. С XV века является кафедральным собором Берийской епархии[1].
В 1500 и 1616 годах собор был полностью перестроен и увеличен в размерах на деньги ходжей братьев Петика и Саноса[3].
Посетивший Алеппо в 1617 году Симеон Лехаци так описал увиденную им картину: «Рядом с дворцом в одном дворе стояли друг около друга четыре церкви: одна — маронитская, другая — греческая и две армянские [имени] Святой Богородицы и св. Cороковицы. В этом году они были заново обновлены и расширены, [стали] большими [и] обширными, куполообразными и сводчатыми, очень красивыми и привлекательными»[4]. Побывавший в городе вслед за Лехаци в 1625 году Пьетро делла Валле в одном из своих писем также восхитился красотой церкви[5], которую он также нашёл вместе с тремя остальными в пригороде города, и все четыре на одной улице, по правую руку. Название улицы он записал как «Giudeida» и пояснил, что по-арабски оно переводится как «Новая [улица]». Самая большая из двух армянских церквей была Церковь Сорока Мучеников, а меньшая — Церковь Богородицы[5].
Расположение соседствующих церквей было таким, что прихожане греческой и маронитской для входа в свои святилища всегда использовали ворота армянских церквей. В 1849 году марониты безуспешно попытались присвоить одни из армянских ворот исключительно в своё пользование[6].
С 1912 по 1929 год к храму пристроили колокольню.
В 1989 году на территории храма был открыт мемориал в память о геноциде армян[1][7].
В 1991 году на территории храма был открыт музей, в экспозициях которого представлена история храма[1].
30 апреля 2015 года в результате атаки ИГИЛ (по другим данным, 28 апреля или ранее в результате подрыва т. н. «туннельной бомбы» боевиками «повстанческих сил»[8]) церковь была разрушена[2].
В 2023 году отреставрированный храм частично пострадала от землетрясения[9].
Внутреннее убранство храма
Собор Сорока Мучеников примечателен иконами древнего и современного письма, особое место среди которых занимает «Страшный суд»[10].
Two of them belong'd to the Armenians, the greater (a fair one indeed) call'd Santi Quaranta, or the forty Saints; and the less, Della Madonna, or our Lady.