Фрагменты Оказаки

Фрагменты Оказаки (англ. Okazaki fragments) — относительно короткие фрагменты ДНК (с РНК-праймером на 5'-конце), которые образуются на отстающей цепи в процессе репликации ДНК. Длина фрагментов Оказаки у E. coli составляет около 1000—2000 нуклеотидов, а у эукариот — обычно 100—200 нуклеотидов.

Фрагменты Оказаки были описаны в 1968 году Рэйдзи Оказаки, Цунэко Окадзаки и их соавторами при изучении репликации ДНК бактериофага у кишечной палочки[1][2].

Механизм

Схема репликации ДНК

Каждый фрагмент Оказаки образуется рядом с репликационной вилкой после РНК-праймера, образуемого праймазой, и далее продолжается ДНК-полимеразой III в случае прокариот. У эукариот праймер и последующий фрагмент Оказаки синтезируется ДНК-полимеразой α. После того, как длина цепочки фрагмента Оказаки достигнет около 20 нуклеотидов, к синтезу ДНК приступают полимеразы δ и ε . Праймер позднее удаляется ферментом с эндонуклеазной активностью, подобной РНКазе H, flap-эндонуклеазе^[англ.] и геликазе/нуклеазе DNA2L^[англ.].

Примечания

1. Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. Mechanism of DNA replication possible discontinuity of DNA chain growth. Jpn J Med Sci Biol. 1967 Jun;20(3):255-260. PMID 4861623
2. Ogawa T, Okazaki T, Discontinuous DNA Replication. Annu. Rev. Biochem. 49:421-457, 1980. doi:10.1146/annurev.bi.49.070180.002225

Литература

1. Inman RB, Schnos M. Structure of branch points in replicating DNA: Presence of single-stranded connections in lambda DNA branch points. J. Mol Biol. 56:319-325, 1971. doi:10.1016/0022-2836(71)90467-0. PMID 4927949
2. Thommes P, Hubscher U. Eukaryotic DNA replication. Enzymes and proteins acting at the fork. Eur. J. Biochem. 194(3):699-712, 1990. doi:10.1111/j.1432-1033.1990.tb19460.x. PMID 2269294