Родился 13 апреля 1870 года в Таганроге в семье Николая Перестиани, коллежского асессора, служившего на таможне и в таганрогском отделении госбанка[3].
С 1886 года выступал на сцене Таганрогского театра под псевдонимом «Иван Неведомов»[4], впоследствии работал как актёр и режиссёр в нескольких передвижных провинциальных театрах. В 1916 году, уже имея 30-летний опыт театральной работы, был приглашён режиссёром в Московский театр «Аквариум». В том же году дебютировал в кино у Евгения Бауэра.
16 февраля 1916 года — памятный день в моей жизни. Это день моего первого появления перед кинокамерой в качестве актёра. Я смутно помню волнение и страх, охватившие меня в утро этого памятного дня, и многие из тяжёлых размышлений, терзавших меня всю первую половину дня вплоть до начала съёмки, бывшей, как я понял впоследствии, ещё одной пробой моих актёрских качеств…
— Иван Перестиани, «75 лет жизни в искусстве» 1962[5]
Вскоре Перестиани, продолжая сниматься, попробовал себя в качестве сценариста и режиссёра немого кино. Летом 1917 году в Крыму и Сочи он поставил для студии «Биофильм» несколько картин, которые доснимались в интерьерах уже в Москве. Сотрудничал с частными студиями, поставил для них ещё десяток фильмов. Получил приглашение от шведской киностудии «Эфа», однако, вдохновлённый революционными преобразованиями, остался в России и начал ставить агитационные фильмы.
В 1920 году Перестиани уехал в Грузию, где снял первый в истории грузинский фильм «Арсен Джорджиашвили» («Убийство генерала Грязнова»), в котором также исполнил одну из второстепенных ролей. Кроме кинорежиссёрской работы преподавал в учебной студии для молодых кинематографистов. В 1923 году он начал работу над фильмом «Красные дьяволята», который стал одним из самых знаменитых и часто цитируемых произведений советского приключенческого немого кино. В 1926 году Перестиани снял несколько продолжений этого фильма — «Преступление княжны Ширванской», «Наказание княжны Ширванской», «Иллан Дилли» и «Савур-могила».
В 1928 году Перестиани был приглашён работать режиссёром на Одесскую киностудию ВУФКУ, в 1929 году перешёл на киностудию «Арменкино». С 1932 года — актёр и преподаватель Тифлисского театрального института и Школы киноактёра при Тифлисской киностудии, консультант сценарного отдела. Одновременно с этим продолжал сниматься в фильмах на «Арменкино» и Тифлисской киностудии.
Оставил книгу мемуаров, выпущенную издательством «Искусство» посмертно (1962)[5].
Перестиани И. Н. 75 лет жизни в искусстве / Вступ. статья Г. Чахирьяна. — М.: Искусство, 1962. — 348 с.
Перестиани И.Из прошлого... // Советский экран : журнал. — 1957. — Декабрь (№ 24). — С. 11.
Кино. Энциклопедический словарь / Гл. ред. С. И. Юткевич; Редкол.: Ю. С. Афанасьев, В. Е. Баскаков, И. В. Вайсфельд и др. — М.: Советская энциклопедия, 1987. — 640 с. — 100 000 экз.