Предполагается, что гаплогруппа возникла около 105—85 тыс. лет тому назад. Гаплогруппы M и N произошли от митохондриальной группы L3 примерно 65 тыс. лет назад (Macaulay et al., 2005)[5]. Возраст коалесценции всех евразийских (M, N) и африканских линий L3 около 71 тыс. л. н. Макрогаплогруппа L3 появилась в Евразии и вернулась в Африку около 70 тыс. лет назад[6][7]. Субклады L3h и L3i датируются ~ 55,1 тыс. л. н., субклады L3h1 и L3h2 датируются ~ 47 тыс. л. н., L3h2 — ~ 31 тыс. лет назад[8]. Носители митохондриальной гаплогруппы L3 мигрировали из Восточной Африки в Центральную Африку от ~ 60 до 35 тыс. лет назад. Увеличение численности носителей L3 в Центральной Африке ок. 4—3 тыс. л. н. соответствует расширениюбанту. Около 3—2 тыс. л. н. носители разных линий L3 распространяются в Восточную и Южную Африку[9].
L3f1b определили у неолитического образца I12534 (4060—3860 лет до настоящего времени) из местонахождения Prettejohn’s Gully (GsJi11) в Кении, L3i2 определили у неолитического образца I8874 (3350—3180 л. н.) из местонахождения Cole’s Burial (GrJj5a) в Кении, L3f определили у неолитического образца I12398/9 (2710—2380 л. н.) из местонахождения Rigo Cave (GrJh3) в Кении, L3x1 определили у неолитического образца I13979 (2490—2350 лет до настоящего времени) из пещеры Gishimangeda Cave в Танзании, L3d1d определили у неолитического образца I12384 (1810—1620 л. н.) из местонахождения Ol Kalou в Кении, L3a2a определили у образца I8904 из местонахождения Kokurmatakore 1 (железный век Кении)[11]
L3e5a определили у двух образцов (около 2030 л. н.) из некрополя Контрада Диана на острове Липари[17]
L3d1a1a и L3e1a1a определены у двух рабов (SJN002 и SJN003) из Мехико, живших в XVI веке[18]
L3b1a определили у человека западноафриканского происхождения (вероятно раб из Сенегамбии), похороненного около 400 л. н. в мезолитической раковинной куче в Кабесу-да-Аморейра (Португалия)[19].
Распространение
Чаще всего данная гаплогруппа встречается в Восточной Африке, в отличие от других территорий Африки, где 2/3 всех митохондриальных ДНК представляют гаплогруппы L1[англ.] и L2[англ.][20].
L3 подразделяется на несколько подгрупп, одна из которых, как предполагается, является предком макрогаплогрупп M и N, от которых произошло большинство неафриканских народов.
Одна из этих линий, которая определяется потерей участка DdeI на np 10394, представляет лишь небольшой процент африканских мтДНК, однако является, по-видимому, предком почти половины всех европейских, азиатских и индейских мтДНК."[21]
По мнению Мака-Майер и др., «L3 больше связана с евразийскими гаплогруппами, чем с наиболее разнообразными африканскими кластерами L1 и L2»[22] L3 — это гаплогруппа, от которой происходят все современные люди за пределами Африки[23].
В Европе на мтДНК макрогаплогруппы L приходится <1 %, при этом ~ 65 % европейских L линий прибыли в историческое время (в том числе L3d1b1a), а оставшиеся 35 % L мтДНК образуют европейские субклады, прибывшие в Европу из Африки к югу от Сахары 11 000 лет назад (L1b1, L2a1k)[24].
Подклассы (потомки) гаплогруппы L3
Филогенетическое дерево
Приведённое ниже филогенетическое дерево основано на публикации Ван Овена (Van Oven 2008) и последующих опубликованных исследованиях.
↑van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.orgАрхивная копия от 17 июня 2016 на Wayback Machine, mtDNA tree Build 2 (14 Oct 2008)