A competição foi dividida em seis fases, todas disputadas em caráter eliminatório. Houve uma fase preliminar disputada entre o vice-campeão, Campos, e o terceiro colocado da última Série C, 7 de Abril. O vencedor avançou para a primeira fase, na qual estavam as equipes classificadas das séries B1 e B2. Nas oitavas de final entraram as equipes classificadas da Série A, além dos campeões das séries B1, Goytacaz, e B2, Angra dos Reis. As fases foram disputadas em ida e volta. Os critérios de desempate foram: maior número de pontos no confronto e saldo de gols. Em caso de empate, a vaga será decidida nos pênaltis. Não há gol qualificado.
BOA:^ O Macaé herdou a vaga do Boavista-RJ, que desistiu da competição por já estar classificado para a Série D de 2019. O Resende, primeiro na lista de espera, também desistiu de jogar o torneio.
Resultados
Fase preliminar
Em itálico, os times que possuem o mando de campo no primeiro jogo do confronto e em negrito os times classificados.
