Os 12 participantes jogaram em grupo único, onde disputaram 2 turnos todos contra todos. O turno conteve as partidas de ida e o returno as de volta, sendo que, ao começar o returno, os pontos foram zerados. Os vencedores de cada turno (os que somaram mais pontos em cada um) foram classificados para as semifinais e as duas com a maior pontuação no campeonato inteiro (turno+returno) uniram-se a eles. Nessa fase, os 4 clubes jogaram em 2 jogos. As equipes vencedoras dos confrontos (às que mais pontuaram nesses) disputam uma final de dois jogos e a maior pontuadora dessas foi declarada Campeã Catarinense de 2000. Caso o campeão do turno tenha sido o mesmo do Returno, este classificou-se diretamente para a final do campeonato, as duas equipes com a maior pontuação jogaram a semifinal e a vencedora dessas enfrentou o campeão dos turnos na final.
Nas fases eliminatórias, venceu o clube que somou mais pontos, independente do saldo de gols, caso houvesse empate, zerar-se-ia o placar e realizar-se-ia uma prorrogação de 30 minutos, se o empate persistisse, o clube com a melhor colocação do campeonato seria declarado o vencedor.
Os 12 participantes jogaram em grupo único, onde disputaram 2 turnos todos contra todos. O turno conteve as partidas de ida e o returno as de volta, sendo que, ao começar o returno, os pontos foram zerados. Os vencedores de cada turno (os que somaram mais pontos em cada um) foram classificados para as semifinais e as duas com a maior pontuação no campeonato inteiro (turno+returno) uniram-se a eles. Nessa fase, os 4 clubes jogaram em 2 jogos. As equipes vencedoras dos confrontos (às que mais pontuaram nesses) disputam uma final de dois jogos e a maior pontuadora dessas foi declarada Campeã Catarinense de 2000. Caso o campeão do turno tenha sido o mesmo do Returno, este classificou-se diretamente para a final do campeonato, as duas equipes com a maior pontuação jogaram a semifinal e a vencedora dessas enfrentou o campeão dos turnos na final.
Nas fases eliminatórias, venceu o clube que somou mais pontos, independente do saldo de gols, caso houvesse empate, o clube com a melhor colocação do campeonato seria declarado o vencedor.
* Os clubes citados primeiro tiveram a segunda partida jogada em casa.
** O Joaçaba se classificou por apresentar melhor pontuação na classificação geral
