Popy werd geboren in Croix-Rousse, een wijk van Lyon. Hij nam op 18-jarige leeftijd dienst in het Franse leger en kon aan het Conservatoire national supérieur de musique te Parijs muziek studeren. Na zijn opleiding werd hij tweede dirigent van de militaire muziekkapel van het 74e Infanterie Regiment te Rouen. In 1901 ging hij weer terug naar zijn familie en in hetzelfde jaar werd hij opvolger van Alexander Luigini als dirigent van de Fanfare Lyonnaise waarmee hij grote successen had. Met dit fanfareorkest won hij tijdens een wedstrijd een eerste prijs, waarna hij door de koning van Italië in Turijn werd gefeliciteerd. Verder was hij dirigent van de harmonie van Villefranche-sur-Saône.
In 1902 huwde hij met Marie Antoinette Bussière met wie hij een dochter en drie zonen had.
Later werkte hij als orkestdirigent in Parijs en als kapelmeester van het orkest van het Théâtre des Célestins te Lyon, waarmee hij vele operettes uitvoert. Sinds 1905 was hij secretaris van de Franse componisten- en auteursfederatie Société des auteurs, compositeurs et éditeurs de musique (Sacem).
Als componist schreef hij meer dan vierhonderd werken. Zijn werken zijn representatief voor de zogenoemde belle époque. Hij bewerkte ook klassieke muziek voor blaasorkesten.
In zijn geboortestad is het park "Parc Francis Popy" naar hem vernoemd, en in Villefranche-sur-Saône werd een straat naar hem vernoemd.
Wolfgang Suppan, Armin Suppan: Das Neue Lexikon des Blasmusikwesens, 4. Auflage, Freiburg-Tiengen, Blasmusikverlag Schulz GmbH, 1994, ISBN 3-923058-07-1
Paul E. Bierley, William H. Rehrig: The heritage encyclopedia of band music : composers and their music, Westerville, Ohio: Integrity Press, 1991, ISBN 0-918048-08-7
Norman E. Smith: March music notes, Lake Charles, La.: Program Note Press, 1986, ISBN 978-0-9617346-1-9
Paul Frank, Wilhelm Altmann: Kurzgefasstes Tonkünstler Lexikon : für Musiker und Freunde der Musik, Regensburg: Gustave Bosse, 1936, 730 p.
Hommage commémoratif au célèbre compositeur Francis Popy 1874-1928, éditions Andrieu Frères. 173 p.