Dopo aver conseguito il dottorato nel 1947, venne assunto come assistente di fisica all'Università Purdue. Benzer venne influenzato dalla lettura del libro di Erwin SchrödingerChe cos'è la vita?, in cui il fisico riflette sulla natura fisica del gene e sull'esistenza di un "codice" della vita. Passato allo studio della fisica e della genetica, divenne uno dei principali esponenti del gruppo del fago.