Nell'ambito del riassetto della rete ospedaliera della Regione Campania il Cotugno, insieme all'ospedale Monaldi, ad indirizzo pneumo-cardiovascolare, ed al CTO Centro Traumatologico Ortopedico[2], hanno formato l'azienda ospedaliera dei Colli[2] La nuova azienda nasce con decreto regionale n. 49 del 27 settembre 2010 per la prosecuzione del piano di rientro del settore sanitario[3].
Giuseppe Morelli, Giuseppe Bottone, Storia dell'Ospedale Domenico Cotugno di Napoli specializzato nella cura di persone affette da malattie infettive, Napoli, Guida, giugno 2007. ISBN 978-88-6042-351-1