Questa voce raccoglie rosa, risultati e statistiche del Krasnodar nella stagione 2016-2017.
Stagione
Dopo un inizio di stagione deludente, a pagare le conseguenze fu l'allenatore Oleg Kononov, che lasciò la guida della stagione dopo tre anni; il suo posto fu preso da Igor' Šalimov.
In campionato la squadra finì la stagione al quarto posto, ottenendo l'accesso all'UEFA Europa League 2017-2018, per la terza stagione consecutiva.
In Europa League il cammino si interruppe agli ottavi di finale (miglior risultato di sempre per il club): dopo aver superato i turni preliminari superando Birkirkara e Partizani Tirana, riuscì a superare la fase a gironi, finendo secondo dietro lo Schalke 04 e davanti a Salisburgo (a pari punti ma avanti negli scontri diretti) e Nizza. Per la prima volta superò anche i sedicesimi, eliminando i turchi del Fenerbahçe, me il cammino si interruppe agli ottavi per mano degli spagnoli del Celta Vigo.
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