Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti il Como Calcio nelle competizioni ufficiali della stagione 1998-1999.
Stagione
Nella stagione 1998-1999 il Como Calcio allenato da Giovanni Trainini ha concorso in due competizioni ufficiali in campionato nel girone A di Serie C1 si è classificato al secondo posto, alle spalle del promosso in Serie B Alzano Virescit, costretta al playoff la squadra lariana è stata eliminata nel doppio confronto di semifinale dalla Pistoiese. Al termine del girone di andata il Como è secondo con 29 punti, molto lontano dall'Alzano che ha otto lunghezze di vantaggio. Nel girone di ritorno fa ancor meglio, raccoglie 32 punti, confermandosi al secondo posto da solo. Ma la regola dei playout si dimostra implacabile, per il Como la semifinale con la Pistoiese è fatale. Nel corso della stagione si sono distinti in fatto di marcature due atleti, Tommaso Rocchi autore di 12 reti e Luca Saudati con 11 centri. La seconda competizione disputata dal Como è stata la Coppa Italia di Serie C, torneo nel quale la squadra lariana disputa il girone C, vinto dall'Albinoleffe, che passa il turno.