En Top14, après un mauvais départ, le club lutte pour le maintien et termine à la 10e place de la phase régulière.
Paradoxalement, le MHR brille en Challenge européen. Les Montpelliérains de Philippe Saint-André éliminent ainsi en demi-finale du Challenge européen les Anglais de Bath sur leur pelouse (10-19) et se qualifient pour la deuxième fois de leur histoire en finale de cette compétition européenne.
Le 21 mai 2021, en finale, les Héraultais affrontent à nouveau une équipe anglaise, les Leicester Tigers à Twickenham. Ils s'imposent (18-17) à Londres et ramènent ainsi la Challenge Cup pour la seconde fois à Montpellier.
Avec 2 défaites, le Montpellier HR termine 12e de la poule A et n'est pas qualifié pour les huitièmes de finale. Ils sont reversés en huitièmes de finale du Challenge européen.