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Pierre Chevallier est un spécialiste d'histoire religieuse et de la franc-maçonnerie. Il est le premier historien à rédiger des ouvrages sur la franc-maçonnerie selon la méthode universitaire et de manière scientifique. Il publie sur ce sujet Histoire de la franc-maçonnerie française en trois tomes entre 1974 et 1975, ouvrages faisant référence parmi les maçonnologues.
Pierre Chevallier, Histoire de la franc-maçonnerie française : La maçonnerie, école de l'égalité (1725-1799), vol. 1, Librairie Arthème Fayard, coll. « Les Grandes études historique », et , 408 p. (ISBN978-2-213-00029-9).
Pierre Chevallier, Histoire de la franc-maçonnerie française : La maçonnerie : missionnaire du libéralisme, vol. 2, Librairie Arthème Fayard, coll. « Les Grandes études historique », , 556 p. (ISBN2-213-00082-4).
Pierre Chevallier, Histoire de la franc-maçonnerie française : La maçonnerie : Église de la République, vol. 3, Librairie Arthème Fayard, coll. « Les Grandes études historique », , 480 p. (ISBN2-213-00162-6).