En 1969, il est invité par le service allemand d'échanges universitaires dans le cadre du « programme des artistes à Berlin ». Il joue depuis un rôle actif en tant que compositeur et chef d'orchestre à Berlin et Tokyo.
Sa musique est jouée par le groupe de taikoKodō et il compose pour des instruments japonais ainsi que pour orchestre symphonique et autres instruments occidentaux.
Ses premières compositions sont caractérisées par la musique sérielle et autres techniques de composition d'Europe occidentale dans les années 1950 et 1960. Dans les années 1960, il découvre la musique traditionnelle japonaise pour ses compositions et à partir de cette époque, celles-ci sont dominées par la confrontation entre les méthodes européennes de composition et des éléments de l'univers sonore de la musique japonaise traditionnelle.
Son catalogue compte environ 130 œuvres, allant du solo de harpe au grand orchestre.
Poème symphonique GIOH, op. 60 ; Enregistré en 1988 chez DENON, The Contemporary Music of Japan, COCO-70960, Kazuhiro Koizumi à la tête de l'orchestre symphonique de Kyoto, Akao Michiko, Yokobue, flûte japonaise traditionnelle.
Funayama, Takashi. 1997. Klänge zwischen Ost und West: Betrachtungen zu Maki Ishiis Fūshi, traduction de Reinhold Quandt et Chris Drake. In Sei no hibiki, tō no hibiki: Ishii Maki no ongaku—Futatsu no sekai kara no sōzō/Westlicher Klang, östlicher Klang: Die Musik Maki Ishiis—Schöpfung aus zwei Musikwelten, édité par Christa Ishii-Meinecke, 118–49. Celle: Hermann Moeck. (ISBN3-87549-053-3).
Kido, Toshirō. 1997. Ikonologie der Klänge : Die Musik Maki Ishiis und das räumliche Konzept in der traditionellen japanischen Musik, traduction de Robin Thompson et Christa Ishii-Meinecke. In Sei no hibiki, tō no hibiki: Ishii Maki no ongaku—Futatsu no sekai kara no sōzō/Westlicher Klang, östlicher Klang: Die Musik Maki Ishiis—Schöpfung aus zwei Musikwelten, édité par Christa Ishii-Meinecke, 180–225. Celle: Hermann Moeck. (ISBN3-87549-053-3).
Mattner, Lothar. 1988. "Verharrende Zeit: Der Komponist Maki Ishii". Neue Zeitschrift für Musik 149, no 11 (novembre) : 19–22.
Sparrer, Walter-Wolfgang. 1999. "Buddhistisches und christliches, expressionistisches und bruitistisches: Zur deutschen Erstaufführung von Maki Ishiis Oper Das Schiff ohne Augen im Berliner Hebbel-Theater". Neue Zeitschrift für Musik 160, no 6 (novembre-décembre) : 58.
Ishii-Meinecke, Christa, ed. (1997). Sounds of West – Sounds of East: Maki Ishii's Music (en anglais, allemand, japonais). Moeck Musikinstrumente + Verlag. (ISBN3-87549-053-3).
