Hardie joue un rôle administratif important dans deux incidents clés au cours de la guerre. Au cours de la bataille de Fredericksburg, il livre les ordres de l'attaque au major général William B. Franklin , le . Franklin ne mène pas son attaque selon les attentes du major général Ambrose E. Burnside, et Hardie est critiqué pour ne pas avoir veillé à ce que les deux généraux se comprennent l'un l'autre correctement. Le , Hardie est l'officier qui livre l'ordre surprise au major général George G. Meade à Frederick, au Maryland, le nommant commandant de l'armée du Potomac, trois jours avant la bataille de Gettysburg[4].
Le , le président Andrew Johnson propose Hardie pour le brevet demajor général dans l'armée régulière, avec une date de prise de rang au [5]. Le sénat américain confirme la nomination, le et la confirme de nouveau le .
Après la guerre
Après la guerre de Sécession, Hardie est l'un des inspecteurs généraux de l'armée. Sa carrière militaire dure 37 ans, jusqu'à sa mort en service actif. Il meurt à Washington, D.C., et est enterré dans le cimetière de Green-Wood, à Brooklyn, New York.
Eicher, John H., and David J. Eicher. Civil War High Commands. Stanford, CA: Stanford University Press, 2001. (ISBN0-8047-3641-3).
O'Reilly, Francis Augustín. The Fredericksburg Campaign: Winter War on the Rappahannock. Baton Rouge: Louisiana State University Press, 2003. (ISBN0-8071-3154-7).
Sears, Stephen W. Gettysburg. Boston: Houghton Mifflin, 2003. (ISBN0-395-86761-4).
(en) « James Allen Hardie », dans New International Encyclopedia [détail des éditions]