De 1896 à 1899, il enseigne à Paris (lycée Condorcet, puis lycée Montaigne), puis aux lycées de Châteauroux et de Poitiers. À la rentrée 1899, il est nommé maître de conférences de langue et littérature latines à la faculté des lettres de Rennes, puis, l'année suivante, à celle de Lille. Il devient professeur adjoint en 1903, professeur de philologie latine (1906), puis de langue et littérature latines toujours à la faculté des lettres de Lille de 1913 à sa mort en 1935.
Henri Bornecque s'est surtout illustré comme éditeur et traducteur de nombreuses œuvres de la littérature latine[1] : Cicéron, Macrobe, Ovide, Quintilien, Pline le Jeune, Sénèque le Rhéteur, Tacite. Il est aussi l'auteur de nombreux ouvrages à caractère pédagogique ou méthodologique concernant le latin : grammaire, conseils pour les épreuves de version et de thème, etc. ; le plus connu est sans doute son dictionnaire pour les candidats au baccalauréat.
La prose métrique dans la correspondance de Cicéron, Paris, E. Bouillon, 1898, XVIII-218-130 p. (thèse).
Précis de prosodie et métrique grecque et latine, Paris, De Boccard, (1re éd. 1900), 160 p. (lire en ligne)
Les déclamations et les déclamateurs d'après Sénèque le Père (coll. « Travaux et mémoires de l'Université de Lille »), Lille, 1902, 214 p.
Les clausules métriques latines (coll. « Travaux et mémoires de l'Université de Lille »), Lille, 1907, XVIII-616 p.
Rome et les Romains : littérature, histoire, antiquités publiques et privées (en collab. avec Daniel Mornet), Paris, Delagrave, 1912, VII-238 p. (nombreuses rééd.).
Tite-Live, Paris, Boivin & Cie,
Le Dictionnaire latin-français du baccalauréat (en collab. avec Fernand Cauët), Paris, Belin, 1936 (nombreuses rééd.).
Les « Catilinaires » de Cicéron : étude et analyse, Paris, Mellottée, , 348 p. (lire en ligne)
La France d’aujourd’hui (en collab. avec Benno Rottgers), Vienne, Tempsky ; Leipzig, G. Freytag, 1910, 258 p., ill.
Traductions
Cicéron, Divisions de l’Art oratoire - Topiques, Les Belles Lettres,
Cicéron (trad. avec Edmond Courbaud), De L'orateur : Livre III, t. III, Les Belles Lettres,
Jean-François Condette, Les lettrés de la République : les enseignants de la Faculté des lettres de Douai puis Lille sous la Troisième République (1870-1940) : dictionnaire biographique, Lille, Université Charles-de-Gaulle-Lille 3, 2006