Il choisit la carrière médicale et il est nommé interne à 19 ans à l'hôpital de l'Antiquaille de Lyon. Il doit cependant, comme tous les étudiants en médecine lyonnais de cette époque, choisir une faculté pour passer son doctorat. Avec son ami Joseph Arthaud, il s'inscrit à la faculté de médecine de Paris et obtient son doctorat en 1836[1]. Sa thèse a pour titre Observations, expériences et propositions sur quelques points de physiologie et de pathologie chirurgicale. Il est parmi les membres de la première conférence de la Société Saint Vincent de Paul , celle de Saint-Étienne-du-Mont.
De retour à Lyon, il devient chirurgien en chef à l'hospice de la Charité de Lyon en 1840 et enseigne l'anatomie, la physiologie, la médecine opératoire, la clinique chirurgicale et l'obstétrique. En fonction en 1849. Il sera professeur d'accouchements à L’École préparatoire de Médecine et de Pharmacie de Lyon de 1856 à 1877 puis professeur de Clinique obstétricale à la Faculté de 1877 à 1886[2], dirigeant de nombreuses thèses[3]. Il est souvent signalé comme ayant pratiqué une césarienne en 1851, intervention rare à cette époque[4].
En 1847, celui-ci acquiert aux enchères la propriété de la Sablière à Caluire et Cuire mais, faute de moyens suffisants pour rembourser les dettes greffées à la propriété de Didier Petit, le précédent propriétaire, il la revendit le 19 octobre 1849 au soyeux Jean-Barthélémy Chazottier.
Marié deux fois, père de sept enfants (son dernier fils, Léon Bouchacourt, sera un pionnier de la radiologie), Antoine Bouchacourt est membre de plusieurs sociétés. Son nom apparait naturellement dans les sociétés médicales : il est président en 1841 de la Société médicale d'émulation de Lyon, membre en 1844 de la Société nationale de médecine et des sciences médicales de Lyon, et il fut président de l'association des médecins du Rhône. Membre correspondant depuis 1889 de l'Académie nationale de médecine, il en devient membre associé en 1894.
Il est aussi membre dès 1863, puis président en 1880, de l'Académie des sciences, belles-lettres et arts de Lyon[5], ainsi que de l'Association lyonnaise des amis des sciences naturelles en 1887.
Publications et discours
Observations, expériences et propositions sur quelques points de physiologie et de pathologie chirurgicale, Lyon , Impr. Didot le Jeune , 1836
Du traitement de la tumeur et de la fistule lacrymale par cautérisation de la membrane muqueuse des paupières, Paris, [s.n.], 1838
Recherches expérimentales et cliniques sur le diagnostic, le pronostic et le traitement des plaies, Paris, Impr. de Béthune et Plon , 1838
Recherches et observations cliniques sur les tumeurs érectiles, Paris, imp. Bethune , 1838
Remarques pratiques sur l'opération césarienne, recueillies aux leçons du professeur Moreau, Paris, 1838, (Extrait des Archives de médecine)
Nouveau procédé de compression applicable à plusieurs maladies chirurgicales (égorgement du sein, du col de l'utérus), Acad. méd. , pli cacheté no 40,
Notes sur un cas d'athésie du vagin et sur son traitement par le débridement multiple , Paris, 1838, (Bulletin thérapeutique)
Des Tumeurs nerveuses sous-cutanées et de leur traitement, Paris, impr. de Ducessois , 1841
Recherches sur les accouchements, les maladies des femmes et des enfants, ... Deuxième Fragment d'un Voyage médical en Allemagne en 1842, Paris, J.-B. Baillière, 1843
Mémoire sur la dégénérescence hydatique et hydatiforme des reins chez le fœtus, Lyon, 1842 ; Paris, J.-B. Ballière ; Lyon, Charles Savy jeune, libraire, quai des Célestins, 1844
Du traitement de la grenouillette par l'injection iodée [Lyon], Imp. Th. Lepagnez, [1846]
Mémoire sur le traitement du goître cystique par les injections iodées, Paris, impr. de Hennuyer, 1849
De l'Accouchement laborieux, de ses causes et de ses indications, Discours prononcé en séance publique de l'administration des hôpitaux, le
Du galactocèle et de son traitement par l'incision suivie de la cautérisation, Lyon, Imprimerie d'Aimé Vingtrinier, 1857
Mémoire sur une altération spéciale de la Vessie ... Paris, Loéquin , 1859
Considérations sur le traitement des suites de l'opération césarienne, Lyon, impr. de A. Vingtrinier, 1860
Observation pour servir à l'histoire des polypes du vagin, Lyon, impr. de A. Vingtrinier, 1864
Étude clinique sur la métrorrhée séreuse des femmes enceintes, Paris, F. Savy, 1868
Éloge historique du docteur F. Devay, discours de réception lu à l'Académie impériale des sciences, arts et belles-lettres de Lyon dans la séance publique du / Lyon : Association typographique, 1869
Académie des sciences, belles-lettres et arts de Lyon, discours prononcé aux funérailles de M. Blanc de Saint-Bonnet, le
Contribution hippocratique à l'histoire de la grossesse nerveuse ou imaginaire, 1893
↑« Bouchacourt (Antoine) », dans Adolphe Vachet, Nos Lyonnais d'hier : 1831-1910, Lyon, (lire en ligne), p. 51
↑Pascaline Davin, La chirurgie à Lyon : évolution au cours des siècles : l'âge d'or du XIXème siècle ; sous la direction de Louis-Paul Fischer [thèse], 2009
↑Voir aussi, Bertrand Morel, Antoine Bouchacourt, premier professeur de clinique d'obstétrique à la Faculté de Médecine de Lyon, thèse de doctorat de médecine, Lyon 1, 1985, 1985LYO1M032.
Alain Brémond et Dominique Saint-Pierre (dir.), « Bouchacourt Antoine », dans Dictionnaire historique des Académiciens de Lyon : 1700-2016, Lyon, éd. ASBLA de Lyon, (ISBN978-2-9559-4330-4, présentation en ligne), p. 203-204.