Anabaena est un genre de cyanobactéries filamenteuses (anciennement appelées algues bleues) de la famille des Nostocaceae , que l'on trouve dans le plancton .
Écologie, biologie
Colonie d'Anabaena à La Réunion .
Ces cyanobactéries sont connues pour leur capacité à fixer l'azote , et elles forment une relation de symbiose avec certaines plantes, telles les fougères aquatiques (du genre Azolla ). Pour cette raison ce sont des organismes de laboratoires qui ont été utilisés pour étudier la capacité de certains polluants (pétroliers notamment[ 1] ) à inhiber la fixation de l'azote (ou d'ailleurs d'autres gaz)[ 1] , [ 2]
C'est l'un des quatre genres de cyanobactéries produisant des neurotoxines qui peuvent dans certaines conditions s'avérer dangereuses tant pour la vie sauvage ou pour les animaux d'élevage et les animaux de compagnie .
Identification, taxonomie
En 1999 , un projet de séquençage ADN a été mené, et a permis de décoder le génome complet d'Anabaena , qui est constitué de 7,2 millions de paires de bases . L'étude s'est concentrée sur les hétérocystes , qui transforment l'azote en ammoniaque . Certaines espèces d'Anabaena ont été utilisées dans des rizières , prouvant qu'elles constituent un engrais naturel efficace.
Leur identification, comme celle des cyanobactéries en général[ 3] , relève de spécialistes . La réaction en chaîne par polymérase (PCR) commence à pouvoir être utilisée pour identifier les espèces par leur ADN[ 4] .
Sur la base de premières analyses phylogénétiques (basées sur l'étude de l'ARN )[ 5] , il existe des formes stables correspondant à chaque cluster phylogénétique (ex : longueur et largeur des akinètes qui pourraient être utiles pour classer les différentes souches d'Anabaena/Aphanizomenon ), les analyses ARN montrant que la classification des anabaenoidés doit être révisée.
Certaines classifications[ 6] , [ 7] préfèrent appeler ce genre Romanoa , cependant Anabaena demeure utilisé par la plupart des bases de données de référence, comme AlgaeBase[ 8] .
Selon World Register of Marine Species (18 février 2016) [ 9] :
Anabaena abnormis Proskina-Lavrenko & Makarova, 1968
Anabaena aequalis Borge, 1906
Anabaena aerophila Brabez, 1941
Anabaena aeruginosa N.L.Gardner, 1927
Anabaena alatospora Gonzalvez & Kamat, 1959
Anabaena anisocca Migula, 1905
Anabaena arenicola (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena aspera Frémy, 1930
Anabaena attenuata Kiselev, 1940
Anabaena augstumalis Schmidle, 1900
Anabaena augstumnalis Schmidle, 1900
Anabaena australica Playfair, 1918
Anabaena austro-africana Cronberg & Komárek, 2004
Anabaena azollae Strasburger, 1884 [ 10]
Anabaena azotica Ley, 1959
Anabaena baltica E.J.Schmidt, 1899
Anabaena batophora Frémy, 1930
Anabaena beckii G.De Toni, 1935
Anabaena belmontica C.G.M.Archibald, 1967
Anabaena berkeleyana Batters, 1902
Anabaena bernardinensis R.Chodat & Zender, 1924
Anabaena bharadwajae B.N.Prasad, 1951
Anabaena bispora Gayral & Mazancourt, 1958
Anabaena bonariensis Seckt, 1922
Anabaena bornetiana F.S.Collins, 1896
Anabaena brevis Kützing, 1845
Anabaena broomei Batters, 1891
Anabaena californica Borge, 1909
Anabaena carmichaelii Cronberg & Komárek, 2004
Anabaena catenula Kützing ex Bornet & Flahault, 1886
Anabaena cavanillesiana González Guerro, 1945
Anabaena chalybea Kützing, 1843
Anabaena chilensis Montagne, 1854
Anabaena circularis
Anabaena compacta (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena confervoides Reinsch ex De Toni, 1897
Anabaena conglobata (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena contorta Bachmann, 1921
Anabaena crispa Roemer, 1845
Anabaena cupressaphila Wolle, 1887
Anabaena cuticularis Brébisson ex Kützing, 1949
Anabaena cyanea (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena cylindrica Lemmermann, 1896
Anabaena cylindrospora Tschernov, 1950
Anabaena debilis Kützing, 1849
Anabaena delicatissima N.L.Gardner, 1927
Anabaena discoidea (Schmidle) Ostenfeld, 1908
Anabaena distans Kützing, 1849
Anabaena duplooyae H.Welsh, 1965
Anabaena echinospora Skuja, 1926
Anabaena effusa (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena elegans Sant'Anna, 1991
Anabaena ellipsoidea (Compère) Komárek, 2012
Anabaena elliptica Lemmermann, 1898
Anabaena elongata Prescott, 1965
Anabaena endogena Rabenhorst, 1865
Anabaena epiphytica Huber-Pestalozzi, 1930
Anabaena epiphytica N.L.Gardner, 1927
Anabaena eucompacta R.Li & M.Watanabe, 1999
Anabaena felisii Bornet & Flahault, 1886
Anabaena fullebornii Schmidle, 1902
Anabaena fuscovaginata Mares, 2010
Anabaena galpinii Claassen, 1961
Anabaena gelatinosa Reinsch, 1866
Anabaena gerdii E.J.Carpenter & Janson, 2001
Anabaena ghosei H.Welsh, 1964
Anabaena gigantea H.C.Wood, 1969
Anabaena glauca Schmidle, 1901
Anabaena gracilis Messikommer, 1956
Anabaena granularis Nägeli ex Kützing, 1849
Anabaena groenlandica Bachmann, 1921
Anabaena hatueyi Komárek, 1988
Anabaena hederulae Kützing, 1849
Anabaena hieronymi Lemmermann, 1898
Anabaena hollerbachii Obukhova (Obuchova), 1959
Anabaena huberi De Toni, 1934
Anabaena hunanensis C.-C.Jao, 1940
Anabaena hyalina Schmidle, 1901
Anabaena imperceptibilis (Bory de Saint-Vincent) Trevisan, 1845
Anabaena inaequalis Bornet & Flahault, 1886
Anabaena incognita H.Welsh, 1964
Anabaena incurva (G.J.Allmann) Trevisan, 1845
Anabaena indica Tiwari & Pandey, 1976
Anabaena indica Zeller ex Bornet & Flahault, 1886
Anabaena involuta Reinsch, 1876
Anabaena irregularis I.F.Lewis, C.Zirkle & R.Patrick, 1933
Anabaena iyengarii Bharadwaja, 1935
Anabaena jaubertiana Montagne, 1859
Anabaena jeejiae Komárek, 2005
Anabaena jonssonii J.B.Petersen, 1923
Anabaena kemptii V.Das & Mitra, 1974
Anabaena kisselevii Proshkina-Lavrenko, 1968
Anabaena kwangtungensis S.-H.Ley, 1947
Anabaena lapponica Borge, 1913
Anabaena laxa A.Braun, 1886
Anabaena leonardii Compère, 1967
Anabaena levanderi Lemmermann, 1906
Anabaena limicola (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena lohammarii Skuja, 1956
Anabaena manchurica Skvortzov, 1937
Anabaena marina N.L.Gardner, 1932
Anabaena marklei J.Copeland, 1936
Anabaena mediocris N.L.Gardner, 1927
Anabaena mehrai Vasishta, 1961
Anabaena mesiana Claassen, 1961
Anabaena microscopica Kützing, 1849
Anabaena minderi Huber-Pestalozzi, 1938
Anabaena miniata Skuja, 1956
Anabaena minima Chernov (Tschernov), 1950
Anabaena minuta Borzì, 1892
Anabaena minuta H.Welsh, 1964
Anabaena minutissima Lemmermann, 1898
Anabaena monilifera Frémy, 1945
Anabaena monticulosa Bory de Saint-Vincent, 1827
Anabaena multispora P.J.L.Dangeard, 1949
Anabaena neapolitana Kützing, 1843
Anabaena nodularioides Geitler & Ruttner, 1935
Anabaena novizelandica Skuja, 1976
Anabaena oblonga De Wildeman, 1897
Anabaena obsoleta Kützing, 1849
Anabaena orientalis S.C.Dixit, 1936
Anabaena orthogona West, 1891
Anabaena oscillarioides Bory de Saint-Vincent ex Bornet & Flahault, 1886
Anabaena papillosa Hirano, 1969
Anabaena passeriniana De Notaris, 1866
Anabaena paulseniana J.B.Petersen, 1923
Anabaena perturbata H.Hill, 1976
Anabaena pintoi González Guerrero, 1950
Anabaena pirinica Petkoff, 1925
Anabaena planctonica Brunnthaler, 1903
Anabaena poulseniana J.B.Petersen, 1923
Anabaena promecespora Frémy, 1930
Anabaena pseudocatenula Claassen, 1961
Anabaena pseudoscillatoria Bory de Saint-Vincent, 1822
Anabaena pulchra Morren, 1835
Anabaena punctata Kützing, 1843
Anabaena ramakaranae Bharadwaja, 1963
Anabaena raytonensis Cholnoky, 1955
Anabaena recta (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena recta Geitler & Ruttner, 1936
Anabaena repens Behre, 1956
Anabaena riparia (Kützing) Trevisan, 1845
Anabaena robusta Kogan & Yazkuleva (Jazkulijeva), 1970
Anabaena rudis Meneghini, 1837
Anabaena saaremaaensis Skuja, 1929
Anabaena salina Alten, 1913
Anabaena salina Liebetanz, 1925
Anabaena scabra G.Dickie, 1880
Anabaena schauderi H.Welsh, 1961
Anabaena scheremetievi
Anabaena sedovii Kosinskaya, 1933
Anabaena shankargarhii A.K.Varma, 1976
Anabaena shensiensis C.-C.Jao, 1948
Anabaena smaragdina Soubeiran, 1858
Anabaena solicola Kondrateva, 1959
Anabaena sphaerica Bornet & Flahault, 1886
Anabaena sphagnicola Tarnavschi & Mitroiu, 1956
Anabaena spinosa Laloraya & Mitra, 1971
Anabaena spiroides (Woronichin) Elenkin
Anabaena stillicidiorum Borzì, 1878
Anabaena subdelicatula C.-C.Jao, 1940
Anabaena subvariabilis R.E.M.Archibald, 1967
Anabaena tatarica Kossinskaja, 1951
Anabaena tenax (J.D.Hooker & Harvey) J.D.Hooker & Harvey, 1847
Anabaena tenuis Messikommer, 1956
Anabaena thermophila G.H.Schwabe, 1947
Anabaena toruloides C.G.M.Archibald, 1967
Anabaena torulosa Lagerheim ex Bornet & Flahault, 1886
Anabaena tschujskaja Obukhova, 1965
Anabaena turkestanica (Kiselev) Komárek, 2005
Anabaena tuzsonii Halász, 1936
Anabaena vaucheriae C.-C.Jao, 1948
Anabaena verrucosa J.B.Petersen, 1923
Anabaena vialis Kützing, 1845
Anabaena voukii G.De Toni, 1836
Anabaena werneri Brunnthaler, 1903
Anabaena westii Virieux, 1913
Anabaena willei N.L.Gardner, 1927
Anabaena wisconsinensis Prescott, 1944
Anabaena woodii G.De Toni, 1934
Voir aussi
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Articles connexes
Références taxinomiques
Références
↑ a et b Singh, A. K.; Gaur, J. P. Inhibition of NO3-, NH4+, and PO43- uptake in Anabaena doliolum exposed to a petroleum oil . Ecotoxicology and Environmental Safety. April 1991; 21 (2):103-108.
↑ Singh, A. K.; Kumar, H. D. Inhibitory effect of petroleum oil on photosynthetic electron trans[fer] system in the cyanobacterium Anabaena doliolum . Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology. December 1991; 47 (6):890-895.
↑ Rippka, R. (1988). Recognition and identification of cyanobacteria . Methods Enzymol 167, 28-67.
↑ Rasmussen, U. & Svenning, M. M. (1998). Fingerprinting of cyanobacteria based on PCR with primers derived from short and long tandemly repeated repetitive sequences. Appl Environ Microbiol 64, 265-272.
↑ Pirjo Rajaniemi, Pavel Hrouzek, Klára Kaštovská, Raphaël Willame, Anne Rantala, Lucien Hoffmann, Jiří Komárek et Kaarina Sivonen, Phylogenetic and morphological evaluation of the genera Anabaena, Aphanizomenon, Trichormus and Nostoc (Nostocales, Cyanobacteria) ; doi: 10.1099/ijs.0.63276-0 IJSEM January 2005 vol. 55 no. 1 11-26 (Résumé )
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↑ USDA, Agricultural Research Service, National Plant Germplasm System. Germplasm Resources Information Network (GRIN-Taxonomy). National Germplasm Resources Laboratory, Beltsville, Maryland., consulté le 18 février 2016
↑ Guiry, M.D. & Guiry, G.M. AlgaeBase . World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. https://www.algaebase.org, consulté le 18 février 2016
↑ World Register of Marine Species , consulté le 18 février 2016
↑ Catalogue of Life Checklist , consulté le 27 décembre 2017