Né à Nabeul, il est envoyé en pension au Lycée de Carthage avant l'indépendance et l'exode en France[1]. Puis il intègre le lycée Carnot de Tunis jusqu'en Math Sup. En 1967, il obtient une maîtrise en informatique à la faculté des sciences Paris VI de Jussieu à Paris. Par ailleurs, militant de Mai 68, il travaille sur le thème de l'autogestion, sujet de son DEA à l'École pratique des Hautes Études sous la direction de Raymond Aron.
« On peut légitimement se demander comment un ministre de l'Environnement peut encore avoir de l'autorité sur des industriels, potentiellement pollueurs, qui financent son parti... Curieusement du reste, Alain Mamou-Mani, qui était responsable de la société de financement, a cru bon de devoir démissionner. »
— (Extrait du livre de Raymond Pronier, Génération verte: Les écologistes en politique, 1992, p.)
En 1992, il fonde le magazine Décision-Environnement[2] qui fusionne en 2000 avec Environnement Magazine[3].
Il a fondé l'association Orée[4] en 1993 qu'il préside jusqu'en 1996.
Il a écrit plusieurs ouvrages (essais, romans) dont La Vie en vert sur le mariage de l'écologie et de l'économie et Au-delà du profit sur les investissements SRI, postfacé par Raoul Vaneigem. Alain Mamou Mani participe aux Les Dix Commandements d'Albert Cohen et Pascal Obispo, en écrivant un essai du même titre avec Jean-Charles Thomas, Dalil Boubakeur et Joseph Haïm Sitruk, en 2000. Il est cité en 2001, par le romancier Maurice Dantec :
« Personne n'a encore eu l'idée de me tirer dessus pour me faire taire. C'est donc vivant que je suis parvenu au point final du quatrième feuillet. L'intervention, fort louable, d'Alain Mamou-Mani, (tentait) d'expliquer à une demi-salle. »
— (Extrait du livre de Maurice Dantec, Laboratoire de catastrophe générale. Journal métaphysique et polémique (2000-2001), Gallimard, 2001, p.)
De à , il a été secrétaire général[5] de l'association[6] présidée par Jean-Louis Borloo : Énergies pour l'Afrique, pour permettre l’accès à l’électricité[7] à tous les africains[8],[9].
En , intéressé par l'étiopathie, il dit sur RTL être sensible à la douleur des autres, tel un scanner, et apprend intuitivement à Didier van Cauwelaert, avoir fait une NDE, à la naissance[10].
En , le mathématicien Robert Azencott, ancien professeur à l’École normale supérieure, demande à Alain Mamou-Mani de devenir Directeur Général de la start-up Miriad Technologies, pionnière de l'intelligence artificielle, poste qu'il occupera jusqu'à fin 2001[12].
Alain Mamou-Mani produit plusieurs films avec Michel Propper dans MP Productions (2001-2008) et Quid Novi (2008-), prenant en outre la fonction de directeur général du groupe BAC Films (2002-2003) de Jean Labadie dont les accords initiaux avec Jean-Marie Messier (ex-PDG de Vivendi Universal), et Studio Canal (qui détient 80 % de Bac Distribution) ainsi que la condamnation financière judiciaire de l'investisseur, Michel Litvak(en), aux États-Unis en 1985, figurant dans les archives du FBI, provoquent la chute[13], et la revente à Millimages, en 2003.
Son roman Kill Jean, comment ils ont tué Jean Seberg, Balzac Éditeur, écrit avec Antoine Lassaigne évoque la mort suspecte en 1979 de la star de la nouvelle vague[14].
Il dirige depuis la collection Domaine Méditerranéen de Balzac Éditions[15] dans laquelle il publie des auteurs venant du Sud de la Méditerranée.
Membre de l'Agora 21 de l'ANSSI, il est juré du prix du Cyber roman/ Agora 21 [16].
Le guide éthique du consommateur, éd. Albin Michel avec l'Observatoire de l'éthique (Association), 2001 ;
Le Grand Livre de la tendresse, collectif, Albin Michel, 2002 (avec Patrice van Eersel, Jacques Salomé, Gérald Pagès ; Christophe Massin, Jean-Pierre Relier, Hugues Reynes ; Suzanne Robert-Ouvray, Boris Cyrulnik ; Christiane Singer, Guy Corneau, Paule Salomon, Gérard Leleu ; Alain Delourme, Odile Ouachée, Jean-Pierre Klein, Luc Boulanger ; Stan Rougier, Michèle Salamagne, Marie de Hennezel) ;
Le rebond économique de la France - 85 innovateurs, acteurs de la croissance et de l'emploi témoignent, de Vincent Lorphelin collectif, Pearson, 2012 ;
La Grippe (roman), éd. Createspace/amazon, 2013 ;
Vénus, la déesse de l'Amour (roman), éd. Createspace/Amazon avec Ornella Bardini, 2013 ;
Au ciel! Rien ne va plus! (pièce de théâtre), éd. Createspace/Amazon, 2013 ;
Du rififi dans les starts-up (roman), éd. Publibook, 2014 ;
Souvenirs d'en face (récit), éd. Createspace/Amazon, 2014 (ISBN978-1496051370)
Kill Jean Comment ils ont tue Jean Seberg (roman), éd. Balzac avec Antoine Lassaigne, 2019 ;
La fille rêvée de Kim Jung-un (roman), éd. La route de la soie avec Antoine Lassaigne, 2023.