TRIM28

Motivo tripartito 28, TRIM28 o TIF1B
Estructuras disponibles
PDB	Buscar ortólogos: PDBe, RCSB  Lista de códigos PDB 1FP0 , 2RO1 , 2YVR  Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Nomenclatura	Otros nombres Transcription intermediary factor 1-beta, (TIF1B), E3 SUMO-protein ligase TRIM28
Símbolos	TRIM28 (HGNC: 16384) KAP1, FLJ29029, RNF96, TF1B, TIF1B
Identificadores externos	OMIM: 601742 HomoloGene: 21175 EBI: TRIM28 GeneCards: Gen TRIM28 UniProt: TRIM28  Bases de datos de enzimas IntEnz: entrada en IntEnz BRENDA: entrada en BRENDA ExPASy: NiceZime view KEGG: entrada en KEEG PRIAM: perfil PRIAM ExplorEnz: entrada en ExplorEnz MetaCyc: vía metabólica
Número EC	2.3.2.27
Locus	Cr. 19 q13.43
Ontología génica Función molecular Control trarnscripcional Referencias: AmiGO / QuickGO
Ortólogos
Especies	Humano Ratón
Entrez	10155 21849
Ensembl	Véase HS Véase MM
UniProt	Q13263 Q62318
RefSeq (ARNm)	NM_005762 NM_011588
RefSeq (proteína) NCBI	NP_005753 NP_035718
Ubicación (UCSC)	Cr. 19: 59.06 – 59.06 Mb
PubMed (Búsqueda)	[1] [2]
v t e

Motivo tripartito 28 (TRIM28), también conocida como factor intermediario transcripcional 1β (TIF1β), es una proteína codificada en humanos por el gen TRIM28.[1]​ [2]​

Gen

El gen TRIM28 se ubica en el cromosoma 19 (humano) brazo largo q, banda 13.43, utilizando la notación internacional del locus, de manera resumida: 19q13.43.

Función

TRIM28 está implicado en el control transcripcional por interacción con el dominio de represión asociado a la caja Krüppel presente en multitud de factores de transcripción.
La proteína se localiza en el núcleo celular y parece encontrarse asociada con regiones específicas de la cromatina.

La proteína TRIM28 pertenece a la familia de motivos tripartitos. Este motivo tripartito incluye tres dominios de unión a zinc, un dominio de dedos RING, una B-box tipo 1, una B-box tipo 2 y una región de hélice superenrollada.[3]​

Interacciones

La proteína TRIM28 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

• CBX5[4]​[5]​[6]​[7]​
• ZNF10[8]​[9]​
• CEBPB[10]​[11]​
• SETDB1[12]​
• Receptor de glucocorticoides[11]​

Véase también

• Corregulador transcripcional

Referencias

1. Reymond A.; Meroni G.; Fantozzi A.; Merla G.; Cairo S.; Luzi L.; Riganelli D.; Zanaria E.; Messali S.; Cainarca S.; Guffanti A.; Minucci S.; Pelicci PG.; Ballabio A. (mayo de 2001). «The tripartite motif family identifies cell compartments». Embo J. 20 (9): 2140-2151. PMC 125245. PMID 11331580. doi:10.1093/emboj/20.9.2140. 
2. Capili AD.; Schultz DC.; RauscherIII FJ.; Borden KL. (enero de 2001). «Solution structure of the PHD domain from the KAP-1 corepressor: structural determinants for PHD, RING and LIM zinc-binding domains». Embo J. 20 (1-2): 165-77. PMC 140198. PMID 11226167. doi:10.1093/emboj/20.1.165. 
3. «Entrez Gene: TRIM28 tripartite motif-containing 28». 
4. Nielsen, Anders Lade; Sanchez, Cecilia; Ichinose, Hiroshi; Cerviño, Margarita; Lerouge, Thierry; Chambon, Pierre; Losson, Régine (Nov. de 2002). «Selective interaction between the chromatin-remodeling factor BRG1 and the heterochromatin-associated protein HP1alpha». EMBO J. (England) 21 (21): 5797-5806. ISSN 0261-4189. PMID 12411497. 
5. Cammas, Florence; Oulad-Abdelghani, Mustapha; Vonesch, Jean-Luc; Huss-Garcia, Yolande; Chambon, Pierre; Losson, Régine (Sep. de 2002). «Cell differentiation induces TIF1beta association with centromeric heterochromatin via an HP1 interaction». J. Cell. Sci. (en inglés) 115 (Pt 17): 3439-3448. ISSN 0021-9533. PMID 12154074. 
6. Nielsen, A.L.; Oulad-Abdelghani M.; Ortiz J.A.; Remboutsika E.; Chambon P.; Losson R. (Apr. de 2001). «Heterochromatin formation in mammalian cells: interaction between histones and HP1 proteins». Mol. Cell (en inglés) 7 (4): 729-739. ISSN 1097-2765. PMID 11336697. 
7. Begg G E, Speicher D W, Rauscher F J (Sep. de 2000). «Molecular determinants for targeting heterochromatin protein 1-mediated gene silencing: direct chromoshadow domain-KAP-1 corepressor interaction is essential». Mol. Cell. Biol. (en inglés) 20 (17): 6449-6465. ISSN 0270-7306. PMID 10938122. 
8. Moosmann P.; Georgiev O.; Le Douarin B.; Bourquin J.P.; Schaffner W. (Dec. de 1996). «Transcriptional repression by RING finger protein TIF1 beta that interacts with the KRAB repressor domain of KOX1». Nucleic Acids Res. (en inglés) 24 (24): 4859-4867. ISSN 0305-1048. PMID 9016654. 
9. Peng H.; Begg G E, Harper S L, Friedman J R, Speicher D W, Rauscher F J (Jun. de 2000). «Biochemical analysis of the Kruppel-associated box (KRAB) transcriptional repression domain». J. Biol. Chem. (en inglés) 275 (24): 18000-18010. ISSN 0021-9258. PMID 10748030. doi:10.1074/jbc.M001499200. 
10. Rooney, J W; Calame K L (Nov. de 2001). «TIF1beta functions as a coactivator for C/EBPbeta and is required for induced differentiation in the myelomonocytic cell line U937». Genes Dev. (en inglés) 15 (22): 3023-3038. ISSN 0890-9369. PMID 12269264. doi:10.1101/gad.937201. 
11. Chang, C J; Chen Y L, Lee S C (Oct. de 1998). «Coactivator TIF1beta interacts with transcription factor C/EBPbeta and glucocorticoid receptor to induce alpha1-acid glycoprotein gene expression». Mol. Cell. Biol. (en inglés) 18 (10): 5880-5887. ISSN 0270-7306. PMID 9742105.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
12. Schultz, David C.; Ayyanathan, Kasirajan; Negorev, Dmitri; Maul, Gerd G.; Rauscher, Frank J. (Apr. de 2002). «SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins». Genes Dev. (en inglés) 16 (8): 919-932. ISSN 0890-9369. PMID 11959841. doi:10.1101/gad.973302. 

Enlaces externos

• MeSH: TRIM28 protein, human (en inglés)

• Datos: Q18035077