Seit 1974 unterrichtet er an der Masaryk-Universität Operngeschichte und Musiktheorie; 1994 wurde er ordentlicher Professor für Musikwissenschaft. 1985 erschien seine Dissertationsschrift Leoš Janáček a hudba 20. století (Leoš Janáček und die Musik des 20. Jahrhunderts). Er beteiligte sich auch als Redakteur und Vorwortautor an der Herausgabe der Werke Janáčeks, über den er mehr als 60 Artikel in musikalischen Zeitschriften veröffentlichte. Mit Leoš Faltus rekonstruierte und ergänzte er mehrere unvollendete Werke Janáčeks, u. a. das Violinkonzert Putování dušičky, die Sinfonie Dunaj und die Oper Živá mrtvola
Weiterhin verfasste Štědroň musiktheoretische Schriften (Formování hudby, Základy mikrotektoniky, Základy polymelodiky), eine Monographie über den Komponisten Josef Berg (Josef Berg – skladatel mezi hudbou, divadlem a literaturou, Brünn 1992) und arbeitete über die Musiker der Renaissance und des Barock wie Claudio Monteverdi (Claudio Monteverdi – génius opery), Adam Michna, Jan Blahoslav und Jakub Jan Ryba. 1992–1993 gab er eine Faksimilesammlung von Barockliedern unter dem Titel Písně rozmanité – Cantilenae diversae heraus
Štědroňs kompositorisches Schaffen umfasst annähernd jeder musikalische Genre von der Schauspiel- und Filmmusik über Oper, sinfonische Werke, Kammermusik bis hin zu Liedern, Werken für Soloinstrumente und elektroakustischen Musik. Auch sein Sohn Miloš Orson Štědroň wurde als Komponist bekannt.
Werke
Meditace für Bassklarinette solo, 1963
Agonie für Violine, Bassklarinette und Schlagzeug, 1964
Stazioni di Via crucis für Bassklarinette, Flöte, Klavier, Cembalo und Schlagzeug, 1964
Lejch für Bassklarinette und Klavier, 1965
Utis, elektroakustische Musik, 1966
Panychida Pasternakovi. konkrete Musik nach einem russischen Text von Boris Pasternak, 1968–1969
Tyche für Orchester, 1969
Verba, Kantate nach Worten des Matthäus-Evangeliums für gemischten Chor und zwei Trompeten, 1969
BIS, elektroakustische Musik, 1971
Aksaky für Klavier, Flöte, zwei Bratschen, Cello und Schlagzeug, 1972
Indiánum sinfonische Freske, 1972
Kolo, Sinfonie, 1973
Gioia dolorosa, Madrigal-Kantate nach der Grabinschrift von Carlo Gesualdo, 1974
Sekvence na smrt Šostakovice, 1975
Balada pro banditu, Musical, Libretto Milan Uhde, 1975
Pohádka máje, Musical, Libretto Milan Uhde, 1975
Koncert pro violoncello a orchestr, 1977
Obrázky ze staré Moravy, 1977
Bez knih jsou národy nahé, Kantate für gemischten Chor und Instrumentalensemble, 1977
Seikilos aus Mähren für Bassklarinette und Klavier, 1979
Valachica für Bassklarinette und Klavier, 1980
Aušvicata biker három für Bassklarinette und Klavier, 1981
Staré a nové renesancní tance für Bassklarinette, Klavier, Streichorchester und Schlagzeug, 1981
Mistr Machaut v Cechách für Mezzosopran, Flöte, Klarinette, Viola und Klavier, 1982
Dávná jména – dávná slova, Liedzyklus nach keltischen Texten für Mezzosopran, Bassklarinette und Klavier, 1982
ROCK 1618 für Streichorchester und vier Schlagzeuger, 2001
Lupi Cantata 3 vocum, 2001
Literatur
Přijdu za poledne, Miloš: můj život s hudbou a lidmi kolem ní: skladatel, muzikolog a pedagog o dětství, literatuře, divadle, hudbě, univerzitě, ale i o Brně (Autobiographie von Miloš Štědroň, bearbeitet von Olga Jeřábková, Fotos Irena Armutidisová ... et al. Zeichnungen Petra Ošlejšková), Barrister & Principal, Berno / Sursum, Tišnov 2012, ISBN 978-80-87474-52-5.