Horstius war mit Elisabeth Schupp, Schwester von Johann Balthasar Schupp, verheiratet und hatte mit ihr acht Kinder, von denen fünf in jungen Jahren starben. Seine Tochter Marie Elisabeth heiratete Lorenz Strauß, Professor der Medizin und Physik an der Universität Gießen. Seine Söhne waren Georg, Mediziner und ebenfalls Stadtphysicus in Frankfurt am Main, und Johann Otto, sachsen-eisenacherLeibmedikus, der eine Tochter von Werner Rolfinck heiratete.
Neben seinen medizinischen Schriften sind hier besonders seine balneologischen Werke erwähnt:[3]
Gebrauch und Würckung deß Schwalbachers Sawer-Brunnens/ Auß Tabernae Montani, vnd anderer vornemen Medicorum Schrifften auch achzehen Jähriger Erfahrung. Willhelm Serlin/ vnd Georg Fickwirt, Franckfurt 1655 (23:634250R im VD 17.).
Kurtze Beschreibung der Sauer-Brunnen Zu Langen-Schwalbach und Dönningstein; Wie auch/ Deß Embser-Berstädter-Brodel- und Wißbades. Georg Fickwirth, Franckfurt 1659 (23:296552S im VD 17.).
Kurtzer Bericht vom Saur- und Brodel-Bronnen zu Langen-Schwalbach Auß 42 Jähriger Erfahrung. Franckfurt am Mayn 1680 (7:664358S im VD 17.).
Beschreibung Deß Wißbades. Von neuem auffgelegt. Henning Müllern, Darmstadt 1680 (7:664519K im VD 17.).
Kurtzer Bericht vom Niederselterischen Sauer-Bronnen/ aus 44. Jähriger Erfahrung. Hennig Müllern/ Fürstl. Buchdr., Darmstadt 1682 (14:075500D im VD 17.).
Kurtzer Bericht Vom Embser-Bad an der Lahn/ in Teutsch und Frantzösisch/ So dann Wiß- und Offenauer-Bad/ Auß Vier und vierzig Jähriger Erfahrung auffgesetzt. Wie auch D. GEORG. MAII, und anderer Gelährten Gedancken über die Brunnen Zu Offenau/ Denig/ St. Menard/ Bachstainach/ [et]c. Sambt angehängtem außführlichem Bericht Doct. MARSILII WEIGELII Vom Embser Bad und Brunnen. Henning Müllern/ Fürstlichen Buchdr., Darmbstadt 1683 (39:142986C im VD 17.).
Friedrich Wilhelm Strieder: Horst (Johann Daniel). In: Grundlage zu einer Hessischen Gelehrten und Schriftsteller Geschichte. Seit der Reformation bis auf gegenwärtige Zeiten. Sechster Band. Cramer, Kassel 1786, S.195–199.
Albrecht Weyermann: Horst, Johann Daniel. In: Nachrichten von Gelehrten, Künstlern und andern merkwürdigen Personen aus Ulm. In Kommission bei P. P. Wolf in Leipzig, Ulm 1798, S.332–334.
Sybill Patan: Johann Daniel Horstius (1616–1685). Sein Leben und sein Wirken sowie seine Bedeutung für die Balneologie des 17. Jahrhunderts (= Arbeiten zur Geschichte der Medizin in Giessen. Nr.15). Schmitz, Gießen 1989, ISBN 3-87711-165-3 (Dissertation).
Ferdinand Neigebaur: Geschichte der kaiserlichen Leopoldino-Carolinischen deutschen Akademie der Naturforscher während des zweiten Jahrhunderts ihres Bestehens. Friedrich Frommann, Jena 1860, S. 189 – Internet Archive
Willi Ule: Geschichte der Kaiserlichen Leopoldinisch-Carolinischen Deutschen Akademie der Naturforscher während der Jahre 1852–1887. Mit einem Rückblick auf die frühere Zeit ihres Bestehens. In Commission bei Wilh. Engelmann in Leipzig, Halle 1889, Nachträge und Ergänzungen zur Geschichte Neigebaur’s, S.147 (Textarchiv – Internet Archive).