Mohaghegi ist in Fachkreisen insbesondere durch ihre umfangreiche Vortragstätigkeit zu Themen des Islam, insbesondere der Stellung der Frau im Islam und des islamischen Lebens in den westlichen Gesellschaften, bekannt geworden.
Fatima und Zainab: Vorbilder für Frauen im Aufbruch – theologische Grundlagen der Shi`a für die Partizipation der Frauen in der Gesellschaft am Beispiel Iran. In: Janbernd Oebbecke, Muhammad Sven Kalisch, Emanuel Towfigh (Hrsg.): Die Stellung der Frau im islamischen Religionsunterricht. Dokumentation der Tagung am 6. Juli 2006 an der Universität Münster (= Islam und Recht. Bd. 5). Lang, Frankfurt am Main u. a. 2007, ISBN 978-3-631-56352-6, S. 87–94.
als Herausgeberin mit Daniela Kästle und Martina Kraml: Heilig – Tabu. Christen und Muslime wagen Begegnungen (= Kommunikative Theologie. Bd. 13). Matthias-Grünewald-Verlag, Ostfildern 2009, ISBN 978-3-7867-2784-2.
mit Klaus von Stosch: Moderne Zugänge zum Islam. Plädoyer für eine dialogische Theologie (= Beiträge zur komparativen Theologie. Bd. 2). Schöningh, Paderborn u. a. 2010, ISBN 978-3-506-76966-4.
Vielfalt der Religionen als eine Chance für das friedliche Zusammenleben – aus islamischer Perspektive. In: Wolfram Weiße, Hans-Martin Gutmann (Hrsg.): Religiöse Differenz als Chance? Positionen, Kontroversen, Perspektiven (= Religionen im Dialog. 3). Waxmann, Münster u. a. 2010, ISBN 978-3-8309-2342-8, S. 119–130.
mit Dietrich Steinwede: Sein sind die schönsten Namen. Texte des Koran in einfacher Sprache. Ausgewählt und übertragen. Patmos, Ostfildern 2011, ISBN 978-3-8436-0002-6.
Religionssensible Schulkultur aus der Sicht muslimischer Familien. In: Gudrun Guttenberger, Harald Schroeter-Wittke (Hrsg.): Religionssensible Schulkultur (= Studien zur Religionspädagogik und Praktischen Theologie. Bd. 4). IKS Garamond, Jena 2011, ISBN 978-3-941854-54-3, S. 307–314.
Gleichberechtigte Teilhabe der Frauen in der Gesellschaft – Einblicke in den Qur'an und historische Beispiele. In: Christine Gerber, Silke Petersen, Wolfram Weiße (Hrsg.): Unbeschreiblich weiblich? Neue Fragestellungen zur Geschlechterdifferenz in den Religionen (= Theologische Frauenforschung in Europa. Bd. 26). Lit, Münster 2011, ISBN 978-3-643-11069-5, S. 177–194.
Rut. In: Bernhard Dressler, Harald Schroeter-Wittke (Hrsg.): Religionspädagogischer Kommentar zur Bibel. Evangelische Verlags-Anstalt, Leipzig 2012, ISBN 978-3-374-03031-6, S. 97–102.
Der „Islam“ in Navid Kermanis literarischen Schriften. In: Michael Hofmann, Klaus von Stosch (Hrsg.): Islam in der deutschen und türkischen Literatur (= Beiträge zur komparativen Theologie. Bd. 4). Schöningh, Paderborn u. a. 2012, ISBN 978-3-506-77133-9, S. 259–266.
Der Dialog der Religionen. Motor erfolgreicher Integration und Veränderung der Gesellschaft. In: Jürgen Manemann, Werner Schreer (Hrsg.): Religion und Migration heute. Perspektiven – Positionen – Projekte. (Norbert Trelle, Bischof von Hildesheim, zum 70. Geburtstag) (= Quellen und Studien zur Geschichte und Kunst im Bistum Hildesheim. 6). Schnell + Steiner u. a., Regensburg 2012, ISBN 978-3-7954-2672-9, S. 28–38.
„Wir sind Kritiker nicht Gegner“. Befreiungsgedanken von Mohammad Mojtahed Schabestari und Hojatolislam Mohsen Kadivar. In: Klaus von Stosch, Muna Tatari (Hrsg.): Gott und Befreiung. Befreiungstheologische Konzepte in Islam und Christentum (= Beiträge zur komparativen Theologie. Bd. 5). Schöningh, Paderborn u. a. 2012, ISBN 978-3-506-77317-3, S. 77–89.
als Herausgeberin und Kommentatorin: Frauen für den Dschihad. Das Manifest der IS-Kämpferinnen. Herder, Freiburg (Breisgau) u. a. 2015, ISBN 978-3-451-34832-7 (In arabischer und deutscher Sprache).
